Qu’est-ce que le microbiome et pourquoi est-il important ?
Le microbiome désigne l’ensemble des micro-organismes, de leurs gènes et de leurs produits présents dans un environnement donné. Chez l’être humain, il se trouve notamment dans l’intestin, sur la peau, dans la bouche et dans les voies respiratoires. Il participe à de nombreuses fonctions biologiques, mais il ne constitue pas à lui seul un diagnostic de santé. Mieux le comprendre peut aider à adopter des habitudes favorables à la santé intestinale.
Qu’est-ce que le microbiome ?
Un microbiome est une communauté complexe composée de bactéries, de virus, de champignons, d’archées et de protozoaires, ainsi que de leur environnement et de leur matériel génétique. Le microbiome intestinal est particulièrement étudié, car il interagit avec les aliments, la paroi intestinale, le système immunitaire et le système nerveux.
La composition de cette communauté varie d’une personne à l’autre. Elle peut être influencée par l’alimentation, l’âge, la génétique, l’environnement, les médicaments, les infections, le sommeil et le stress. Elle évolue également au cours de la vie. Il n’existe donc pas une composition microbienne idéale identique pour tout le monde.
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Quelle est la différence entre microbiote et microbiome ?
Les deux termes sont proches, mais ne désignent pas exactement la même chose :
- Le microbiote correspond aux micro-organismes vivants présents dans un milieu, par exemple les bactéries de l’intestin ou de la peau.
- Le microbiome comprend le microbiote, son environnement, ses gènes et les molécules produites par ces micro-organismes.
Dans le langage courant, ces mots sont parfois utilisés comme des synonymes. Pour parler simplement des organismes eux-mêmes, on peut employer microbiote. Pour évoquer l’ensemble de l’écosystème et de ses fonctions, microbiome est plus précis.
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À quoi sert le microbiome intestinal ?
Digestion et production de métabolites
Certains composants des aliments, notamment une partie des fibres, ne sont pas entièrement digérés par les enzymes humaines. Des microbes du côlon peuvent les fermenter et produire des métabolites, dont des acides gras à chaîne courte comme l’acétate, le propionate et le butyrate. Ces composés peuvent contribuer au fonctionnement de la muqueuse intestinale et à l’équilibre local, sans que cela signifie qu’un aliment ou une bactérie puisse traiter une maladie.
Interaction avec les défenses immunitaires
Le microbiote intestinal échange en permanence avec la barrière intestinale et les cellules immunitaires. Cette relation participe à la maturation et à la régulation des réponses immunitaires. Elle aide aussi à limiter l’installation de certains micro-organismes indésirables. Les interactions sont complexes et dépendent du contexte individuel.
Communication entre l’intestin et le cerveau
L’axe intestin-cerveau désigne les échanges bidirectionnels entre le système digestif et le système nerveux. Ils impliquent notamment le nerf vague, les hormones, les signaux immunitaires et les métabolites microbiens. Des associations entre microbiote, stress et humeur sont étudiées, mais elles ne permettent pas de conclure qu’un test ou un probiotique peut prévenir ou traiter un trouble mental. En cas de symptômes psychiques, un professionnel de santé reste la bonne ressource.
Pourquoi la diversité microbienne est-elle importante ?
La diversité microbienne correspond à la variété des micro-organismes et à la répartition de leurs abondances. Une communauté diversifiée peut offrir davantage de fonctions complémentaires et être plus adaptable face à certaines perturbations. Toutefois, la diversité seule ne suffit pas à définir un microbiome sain : les espèces présentes, leurs fonctions, les symptômes et le contexte médical comptent également.
Une alimentation peu variée et pauvre en fibres, certains traitements, le stress chronique ou une maladie peuvent modifier temporairement ou durablement la composition du microbiote. Ces changements sont parfois associés à des troubles de santé, mais une association ne prouve pas qu’un déséquilibre soit l’unique cause d’un problème.
Comment soutenir son microbiome au quotidien ?
Les habitudes suivantes sont généralement compatibles avec une alimentation équilibrée et peuvent contribuer à la santé intestinale :
- Varier les végétaux : alternez légumes, fruits, légumineuses, céréales complètes, noix et graines selon vos préférences et votre tolérance.
- Augmenter progressivement les fibres : une hausse trop rapide peut accentuer les gaz ou les ballonnements. Buvez suffisamment et adaptez les quantités à votre situation.
- Inclure des aliments riches en polyphénols : certaines baies, herbes, épices, légumineuses, légumes et boissons comme le thé en contiennent.
- Choisir les aliments fermentés avec discernement : le yaourt nature, le kéfir, la choucroute ou le kimchi peuvent s’intégrer à l’alimentation, mais ils ne conviennent pas à tout le monde et ne remplacent pas un traitement.
- Prendre soin du mode de vie : activité physique régulière, sommeil suffisant et gestion du stress soutiennent la santé générale et peuvent influencer l’écosystème intestinal.
- Utiliser les antibiotiques uniquement selon prescription : ne modifiez jamais un traitement sans l’avis du professionnel qui l’a prescrit.
Les prébiotiques sont des substrats utilisés par certains micro-organismes, tandis que les probiotiques sont des micro-organismes vivants qui peuvent avoir un effet dans certaines situations. Leur intérêt dépend de la souche, de la dose et de la personne. Demandez conseil à un professionnel de santé si vous êtes enceinte, immunodéprimé, atteint d’une maladie chronique ou si vous prenez des médicaments.
C’est quoi l’alimentation microbiome ?
L’expression alimentation pour le microbiome ne désigne pas un régime médical unique. Elle fait généralement référence à une alimentation variée, riche en fibres et en aliments peu transformés, qui fournit différents substrats aux microbes intestinaux. Il n’est pas nécessaire de supprimer de nombreux aliments ni de suivre une liste universelle. Commencez par ajouter progressivement des végétaux que vous tolérez, observez vos réactions et sollicitez un diététicien ou un médecin en cas de symptômes persistants.
C’est quoi le microbiome de la peau ?
Le microbiome de la peau est l’écosystème de micro-organismes vivant à sa surface et dans ses couches superficielles. Il varie selon la zone du corps, l’humidité, le sébum, l’âge, l’environnement et les produits utilisés. Il participe aux interactions avec la barrière cutanée, mais cela ne signifie pas que tous les problèmes de peau sont causés par le microbiome. Pour une irritation, une infection présumée ou une lésion persistante, consultez un médecin ou un dermatologue.
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Qu’est-ce que la dysbiose ?
La dysbiose est un terme utilisé pour décrire une modification de la composition ou du fonctionnement d’une communauté microbienne. Elle peut correspondre à une baisse de diversité, à une variation de certaines populations ou à une altération des fonctions microbiennes. Ce terme ne constitue pas un diagnostic unique et son interprétation dépend du contexte. Des ballonnements, une diarrhée, une constipation ou des douleurs peuvent avoir de nombreuses causes.
Que peut indiquer un test du microbiome intestinal ?
Un test du microbiome analyse généralement un échantillon de selles afin d’estimer la présence relative de certains micro-organismes et, selon la méthode, certaines fonctions microbiennes. Les techniques peuvent inclure le séquençage ciblé ou le séquençage métagénomique. Les résultats peuvent contribuer à mieux comprendre un profil microbien, mais ils ne donnent pas une image complète de l’intestin et ne permettent pas, à eux seuls, de diagnostiquer une maladie.
Un test commercial ne doit pas remplacer un bilan médical, une analyse prescrite ou un traitement. Les recommandations alimentaires issues d’un rapport doivent être considérées comme générales et discutées avec un professionnel lorsque les symptômes sont importants. Le test du microbiome intestinal d’InnerBuddies peut fournir des informations éducatives sur la composition microbienne, mais ses résultats doivent être interprétés avec prudence.
Quand demander un avis médical ?
Consultez un professionnel de santé si les troubles digestifs sont persistants, sévères ou s’aggravent, ou s’ils s’accompagnent de sang dans les selles, de fièvre, de vomissements répétés, d’une perte de poids involontaire, de signes de déshydratation ou d’une douleur importante. N’attendez pas les résultats d’un test du microbiome pour demander un avis en cas de symptôme préoccupant.
Questions fréquentes
Qu’est-ce qu’un microbiome ?
Le microbiome est l’ensemble formé par les micro-organismes d’un environnement, leur matériel génétique, leur environnement et les substances qu’ils produisent. Le microbiome intestinal est l’un des écosystèmes microbiens humains les plus étudiés.
Quelle est la différence entre microbiote et microbiome ?
Le microbiote désigne les micro-organismes vivants. Le microbiome inclut ces organismes ainsi que leur environnement, leurs gènes et leurs fonctions. Dans la conversation courante, les deux termes peuvent toutefois être employés de façon proche.
C’est quoi l’alimentation microbiome ?
Il s’agit généralement d’une alimentation variée, riche en fibres et en aliments peu transformés, qui peut soutenir la diversité et l’activité du microbiote intestinal. Elle doit être adaptée à la tolérance et aux besoins de chacun.
C’est quoi le microbiome de la peau ?
Le microbiome de la peau est l’ensemble des micro-organismes qui vivent sur et dans la surface cutanée. Sa composition varie selon les zones et contribue aux interactions avec la barrière de la peau.