Qu’est-ce que le microbiome ? Définition et rôle dans l’intestin

Qu’est-ce que le microbiome ? Le microbiome est l’ensemble formé par les micro-organismes présents dans un environnement, leurs gènes et les interactions avec cet environnement. Dans l’intestin, cet écosystème comprend notamment des bactéries, mais aussi des virus et des champignons. Il participe à de nombreuses fonctions, dont la digestion et les échanges avec l’organisme. Une alimentation variée et riche en végétaux peut contribuer à soutenir un microbiome intestinal diversifié, sans garantir à elle seule un résultat médical.

Le terme microbiome est également utilisé pour parler d’autres environnements du corps, comme la peau, la bouche ou le vagin. Pour comprendre son intérêt en médecine et en santé digestive, il est utile de distinguer le microbiome du microbiote.

Découvrez le test du microbiome

Laboratoire européen certifié ISO • Stabilité de l'échantillon pendant le transport • Données sécurisées conformément au RGPD

Kit de test du microbiome

Microbiote et microbiome : quelle différence ?

Les deux mots sont proches et leur usage peut varier selon les publications scientifiques. En pratique, on peut retenir la distinction suivante :

<

Terme	Définition	Exemple
Microbiote	Communauté de micro-organismes vivant dans un environnement donné.	Les micro-organismes présents dans l’intestin.
Microbiome	Ensemble plus large comprenant le microbiote, son patrimoine génétique et le contexte dans lequel il vit et agit.	L’écosystème intestinal et les interactions entre ses différents éléments.

En résumé, le microbiote correspond surtout aux habitants, tandis que le microbiome décrit les habitants et leur écosystème. Dans le langage courant, microbiome peut toutefois être employé comme synonyme de microbiote. Le contexte est donc important.

Consultez des exemples de recommandations de la plateforme InnerBuddies

Découvrez en avant-première les recommandations nutritionnelles, de compléments alimentaires, de journal alimentaire et de recettes qu'InnerBuddies peut générer en fonction de votre analyse du microbiome intestinal.

Voir des exemples de recommandations

Quel est le rôle du microbiome intestinal ?

Le microbiome intestinal évolue au cours de la vie et varie d’une personne à l’autre. Il est influencé par l’alimentation, l’âge, l’environnement, certaines maladies et l’usage de médicaments. Ses fonctions sont étudiées activement, mais elles ne permettent pas de tirer des conclusions médicales individuelles à partir d’une seule caractéristique microbienne.

<

• Digestion des fibres : certains micro-organismes transforment des fibres que l’organisme humain digère difficilement et produisent des composés, comme des acides gras à chaîne courte.
• Barrière intestinale : la présence de nombreuses espèces contribue à l’occupation de l’espace intestinal et peut limiter la place disponible pour certains micro-organismes indésirables.
• Interactions avec l’immunité : le microbiome participe aux échanges avec le système immunitaire, sans que cela signifie qu’il protège à lui seul contre une maladie.
• Métabolisme et nutrition : les micro-organismes peuvent modifier certains nutriments et contribuer à la production ou à la disponibilité de molécules d’intérêt, notamment des vitamines dans certaines conditions.
• Communication entre l’intestin et le cerveau : l’intestin et le cerveau communiquent par plusieurs voies. Le microbiome pourrait contribuer à ces échanges, mais les liens avec l’humeur et les troubles neurologiques restent complexes et ne justifient pas d’autodiagnostic.

C’est quoi l’alimentation microbiome ?

L’alimentation microbiome n’est pas un régime médical standardisé. Cette expression désigne généralement une façon de manger qui apporte des fibres, une grande diversité d’aliments végétaux et, si elles sont bien tolérées, certaines préparations fermentées. L’objectif est de fournir différents substrats aux micro-organismes intestinaux et de favoriser une alimentation globalement équilibrée.

Principes simples

1. Varier les végétaux : alternez légumes, fruits, légumineuses, céréales complètes, noix et graines.
2. Augmenter les fibres progressivement : une hausse trop rapide peut provoquer des ballonnements. Augmentez les quantités par étapes et buvez suffisamment selon vos besoins.
3. Choisir des aliments fermentés si vous les tolérez : leur teneur en micro-organismes vivants varie selon le produit et sa fabrication.
4. Limiter la place des produits ultra-transformés et des sucres ajoutés : il s’agit d’un repère général d’équilibre alimentaire, pas d’une interdiction absolue.
5. Tenir compte de votre tolérance : un aliment présenté comme bénéfique n’est pas forcément adapté à tout le monde, notamment en cas de maladie digestive connue.

En cas de symptômes persistants, de régime d’exclusion ou de maladie diagnostiquée, demandez conseil à un médecin ou à un diététicien avant de modifier fortement votre alimentation.

Quels aliments peuvent soutenir le microbiome intestinal ?

Aucun aliment ne transforme à lui seul le microbiome. La régularité et la diversité de l’alimentation comptent davantage qu’une liste d’aliments dits miracles.

Auto-évaluation en 2 minutes Un test du microbiome intestinal est-il utile pour vous ? Répondez à quelques questions rapides et découvrez si un test du microbiome est réellement utile pour vous. ✔ Prend seulement 2 minutes ✔ Basé sur vos symptômes et votre mode de vie ✔ Recommandation claire oui/non Vérifier si un test me convient →

Aliments riches en fibres

• Légumes : poireaux, oignons, ail, asperges, artichauts, carottes et légumes à feuilles.
• Fruits : pommes, poires, agrumes, fruits rouges et bananes, notamment lorsqu’elles sont encore légèrement vertes.
• Légumineuses : lentilles, pois chiches, haricots et pois cassés.
• Céréales complètes : avoine, orge, seigle et pain complet.
• Noix et graines : amandes, noix, graines de lin et graines de chia.

Aliments fermentés

Le yaourt nature, le kéfir, le miso, le tempeh, le kimchi et la choucroute non pasteurisée sont des exemples d’aliments fermentés. Tous ne contiennent pas nécessairement les mêmes micro-organismes vivants, et la pasteurisation ou la cuisson peut modifier leur composition. Ils peuvent compléter une alimentation variée, mais ne remplacent ni un traitement ni un avis médical.

Sources de polyphénols

Les baies, le raisin, les prunes, le thé, le cacao non sucré, les noix et de nombreux légumes apportent des polyphénols. Ces composés sont étudiés pour leurs interactions possibles avec le microbiome, mais il n’est pas nécessaire de consommer des produits spécifiques ou des compléments pour adopter une alimentation favorable à la santé globale.

Et le microbiome de la peau ?

Le microbiome de la peau correspond à l’ensemble des micro-organismes qui vivent à sa surface et dans ses différentes zones, ainsi qu’à leurs gènes et interactions avec cet environnement. Sa composition dépend notamment de la zone du corps, de l’humidité, du sébum, de l’âge et des habitudes de soin. Il participe à l’écosystème cutané, mais il ne faut pas confondre les informations générales sur le microbiome de la peau avec un diagnostic dermatologique.

Devenez membre de la communauté InnerBuddies

Effectuez un test du microbiome intestinal tous les deux mois et suivez vos progrès tout en respectant nos recommandations

Prenez un abonnement InnerBuddies

Pourquoi faire un test du microbiome intestinal ?

Un test du microbiome intestinal réalisé à partir des selles peut fournir une photographie partielle des micro-organismes détectés dans un échantillon à un moment donné. Les méthodes, les bases de comparaison et l’interprétation peuvent varier selon les laboratoires. Un résultat ne suffit pas à diagnostiquer une maladie, à expliquer tous les symptômes ou à déterminer avec certitude le régime alimentaire adapté.

Ces tests peuvent s’inscrire dans une démarche d’information ou de recherche, mais ils ne remplacent pas un examen médical. En cas de douleurs importantes, de sang dans les selles, de fièvre, de perte de poids involontaire, de diarrhée persistante ou de symptômes qui s’aggravent, consultez rapidement un professionnel de santé.

FAQ sur le microbiome

Qu’est-ce qu’un microbiome ?

Le microbiome est l’écosystème composé des micro-organismes d’un environnement, de leurs gènes et de leurs interactions avec cet environnement. Dans l’intestin, il comprend notamment des bactéries, des virus et des champignons.

Quelle est la différence entre microbiote et microbiome ?

Le microbiote désigne principalement la communauté de micro-organismes. Le microbiome englobe cette communauté, son patrimoine génétique et son environnement. Les termes sont parfois employés différemment selon les sources.

Auto-évaluation en 2 minutes Un test du microbiome intestinal est-il utile pour vous ? Répondez à quelques questions rapides et découvrez si un test du microbiome est réellement utile pour vous. ✔ Prend seulement 2 minutes ✔ Basé sur vos symptômes et votre mode de vie ✔ Recommandation claire oui/non Vérifier si un test me convient →

C’est quoi l’alimentation microbiome ?

C’est une expression utilisée pour décrire une alimentation variée, riche en fibres végétales et pouvant inclure des aliments fermentés. Elle vise à soutenir l’écosystème intestinal, sans constituer un traitement médical ni une méthode universelle.

C’est quoi le microbiome de la peau ?

Le microbiome de la peau est l’ensemble des micro-organismes et des éléments associés présents sur la peau. Il varie selon les zones du corps et les caractéristiques de chaque personne. Une question ou un problème cutané persistant doit être évalué par un professionnel de santé.

À retenir

Le microbiome décrit un écosystème de micro-organismes, de gènes et d’interactions. Dans l’intestin, il est associé à la digestion, à la transformation de certains nutriments et aux échanges avec l’organisme. Pour le soutenir au quotidien, privilégiez une alimentation diversifiée, augmentez les fibres progressivement et choisissez des aliments fermentés si vous les tolérez. Ces conseils restent généraux et ne remplacent pas un accompagnement médical personnalisé.