Quels tests pour les problèmes digestifs ?

Les symptômes digestifs tels que ballonnements, constipation, diarrhée, reflux acide et douleurs abdominales sont extrêmement fréquents et peuvent affecter considérablement la vie quotidienne. Comprendre la cause profonde de ces problèmes nécessite des approches diagnostiques efficaces et ciblées. Cet article de blog explore une série de tests digestifs qui fournissent des informations sur la santé intestinale, en mettant l'accent sur l'analyse du microbiome intestinal. En comparant les outils diagnostiques traditionnels — tels que l'analyse des selles, la gastroscopie, la coloscopie, l'imagerie et les tests de la fonction hépatique — aux méthodes modernes de test du microbiome, nous visons à démystifier quels tests sont les mieux adaptés pour identifier des affections digestives spécifiques. Apprenez comment la combinaison de différentes évaluations, y compris les tests avancés du microbiome, peut vous orienter vers un soulagement significatif des symptômes et une meilleure santé digestive globale.

1. Tests digestifs pertinents pour l’analyse du microbiome intestinal

Le test du microbiome intestinal est apparu comme un outil puissant pour comprendre la santé digestive. Intégré au paysage des tests digestifs, l’analyse du microbiome offre une vue détaillée de l’écosystème microbien présent dans votre tractus gastro-intestinal. Ces microbes — bactéries, archées, champignons et virus — jouent des rôles cruciaux dans la digestion, la fonction immunitaire, l’absorption des nutriments et même la santé mentale. Les déséquilibres de cet écosystème, appelés dysbioses, sont de plus en plus associés à des problèmes digestifs courants comme le syndrome de l’intestin irritable (SII), les maladies inflammatoires de l’intestin (MII), la constipation, les ballonnements et même les sensibilités alimentaires.

Contrairement aux tests digestifs traditionnels qui se concentrent sur des anomalies structurales ou biochimiques, les tests du microbiome évaluent la composition, la fonction et la santé de la population microbienne intestinale. Les types de tests du microbiome les plus courants comprennent :

• Séquençage de l’ADN fécal : Utilise le séquençage de nouvelle génération (NGS) pour déterminer les souches spécifiques et les abondances relatives des microbes présents dans les selles, offrant des informations sur la diversité et l’équilibre microbiens.
• Profilage de la diversité microbienne : Mesure la variété et l’abondance des espèces bactériennes, indiquant si l’écosystème microbien est diversifié ou dominé par quelques espèces opportunistes souvent liées aux symptômes digestifs.
• Analyse fonctionnelle : Analyse les produits microbiens, comme les acides gras à chaîne courte (AGCC), le métabolisme des acides biliaires ou les marqueurs inflammatoires, qui reflètent directement l’activité microbienne et la capacité de l’intestin à soutenir la digestion et la fonction immunitaire.

Le test du microbiome intestinal fonctionne en complément des tests digestifs standard. Alors qu’un test du microbiome ne peut pas détecter des ulcères ou des polypes (comme peut le faire une endoscopie ou une coloscopie), il est extrêmement utile pour évaluer des problèmes digestifs chroniques ou fonctionnels qui échappent souvent aux évaluations visuelles ou biochimiques.

Les professionnels de santé peuvent recommander un test du microbiome intestinal lorsque :

• Le patient présente des symptômes persistants sans diagnostic clair suite à l’imagerie ou à l’endoscopie.
• Il existe une suspicion de SII, SIBO ou d’inflammation inexpliquée.
• Les patients s’intéressent à la prévention par l’optimisation du microbiome.
• Il y a eu une utilisation récente d’antibiotiques et une inquiétude concernant l’appauvrissement microbien.

Le Test du microbiome InnerBuddies est une option qui offre une répartition personnalisée de la santé du microbiome. Il intègre le séquençage de l’ADN avec des évaluations du mode de vie pour fournir à la fois un diagnostic et des recommandations de traitement actionnables.

Cependant, comme tous les outils, les tests du microbiome ont des limites. Ils ne diagnostiquent pas les maladies directement mais identifient des marqueurs de risque et des schémas microbiens cohérents avec des dysfonctionnements digestifs. Ils reposent également sur des échantillons de selles, qui représentent la microbiote du côlon distal et peuvent ne pas refléter l’ensemble du tractus gastro-intestinal avec précision.

Malgré cela, les bénéfices sont substantiels. Les informations issues des données du microbiome permettent d’orienter des interventions ciblées comme des probiotiques, des prébiotiques, des modifications alimentaires et du mode de vie. Celles-ci peuvent conduire à une amélioration des symptômes et à un système digestif plus résilient, en particulier lorsqu’elles sont associées à des tests traditionnels pour confirmation et investigation approfondie.

2. Analyse des selles : déverrouiller l’environnement microbien de votre intestin

L’analyse des selles est l’un des outils les plus fondamentaux dans la voie diagnostique des problèmes digestifs. Elle permet aux cliniciens d’évaluer ce qui se passe profondément dans l’intestin sans procédures invasives. Le terme « analyse des selles » englobe une grande variété de tests effectués sur un seul échantillon fécal pour évaluer les infections, l’inflammation et la santé microbienne.

Les types d’analyses des selles généralement prescrites incluent :

• Tests basés sur la culture : Historiquement la référence, ces tests cultivent des bactéries et des agents pathogènes vivants sur des milieux de croissance. Ils sont excellents pour identifier des infections spécifiques comme Salmonella, Shigella et E. coli, bien qu’ils soient limités pour détecter des microbes anaérobies ou à croissance lente.
• Panneaux de pathogènes : Utilisent la réaction en chaîne par polymérase (PCR) pour détecter l’ADN viral, bactérien et parasitaire. Ces tests sont rapides et très sensibles, efficaces pour identifier les infections gastro-intestinales qui provoquent diarrhée, crampes ou présence de sang dans les selles.
• Tests microbiomes complets : Ne se contentent pas de rechercher des agents pathogènes, mais évaluent également les bactéries bénéfiques, les indices de diversité, la prolifération fongique et des marqueurs comme la calprotectine (pour l’inflammation) et les AGCC (pour la fonction microbienne). C’est là que des tests comme le Test du microbiome InnerBuddies excellent.

L’analyse des selles révèle des indicateurs importants de la santé intestinale, tels que :

• La présence d’inflammation : Détectée par des marqueurs comme la lactoferrine ou la calprotectine, qui suggèrent une MII ou une réponse immunitaire en cours.
• Suroccupation pathogène : Bactéries, levures ou parasites identifiables qui perturbent l’harmonie intestinale et imitent souvent des troubles fonctionnels.
• Appauvrissement microbien : Faible diversité ou absence d’espèces clés (comme F. prausnitzii) suggérant une résilience intestinale affaiblie.

Un avantage remarquable du test microbiome fécal est la capacité à recommander des traitements individualisés. Par exemple, les patients ayant une faible abundance de bactéries productrices de butyrate peuvent se voir conseiller d’augmenter les amidons résistants et les fibres. Ceux présentant une prolifération de Candida peuvent être orientés vers des thérapies antifongiques et l’élimination des sucres simples de leur alimentation.

Avant de réaliser un test, les patients reçoivent généralement des consignes d’éviter les probiotiques et certains médicaments comme les antibiotiques pendant au moins cinq jours avant la collecte. La procédure implique un kit simple à utiliser à domicile avec un écouvillon ou un gobelet de collecte, selon la complexité du test.

Les résultats sont généralement disponibles en une à deux semaines, et leur interprétation est mieux réalisée avec un accompagnement clinique. Des panels plus avancés comme ceux proposés par InnerBuddies intègrent les résultats des tests du microbiome avec des analyses pilotées par l’IA pour une meilleure planification du traitement. Associée aux symptômes et aux antécédents médicaux, l’analyse des selles offre un aperçu approfondi des causes cachées des problèmes intestinaux.

3. Procédures de gastroscopie : visualiser le tractus digestif supérieur

La gastroscopie, également appelée endoscopie haute ou œsophagogastroduodénoscopie (OGD), est l’un des examens les plus utiles pour visualiser la partie supérieure du tractus gastro-intestinal — à savoir l’œsophage, l’estomac et le duodénum (la première partie de l’intestin grêle). Cette procédure permet une inspection directe, la réalisation de biopsies et, si nécessaire, une intervention thérapeutique (comme arrêter un saignement ou retirer un corps étranger).

Réalise sous sédation, la gastroscopie consiste à faire passer un tube flexible muni d’une caméra par la gorge. C’est une procédure ambulatoire de 15 à 30 minutes avec un temps de récupération minimal, généralement terminée en quelques heures. La préparation consiste principalement à jeûner pendant au moins 6 à 8 heures avant le test.

La gastroscopie est utilisée pour évaluer des symptômes tels que :

• Brûlures d’estomac chroniques ou reflux acide (potentiellement RGO)
• Saignement ou anémie
• Nausées ou vomissements persistants
• Perte de poids inexpliquée
• Difficulté à avaler

Les affections qu’une gastroscopie peut détecter incluent :

• Œsophagite et gastrite : Signes d’inflammation chronique pouvant être causés par une infection à H. pylori, l’usage d’AINS ou une autoimmune.
• Ulcères et érosions : Lésions de la muqueuse gastrique pouvant être à l’origine de douleurs ou de saignements.
• Maladie cœliaque : Diagnostiquée par des biopsies duodénales montrant une atrophie villositaire.
• Œsophage de Barrett : Modification précancéreuse de la muqueuse œsophagienne due à un RGO chronique.

Il est important de noter que des analyses microbiologiques et de pathogènes peuvent être réalisées sur les tissus obtenus par biopsie. Par exemple, tester ces échantillons pour Helicobacter pylori via des tests rapides à l’urée ou par PCR permet de confirmer ou d’écarter cette infection bactérienne courante liée aux ulcères et à la gastrite.

La gastroscopie ne permet pas d’évaluer largement le microbiome intestinal. Cependant, si elle est associée à une analyse des selles, en particulier via des tests comme le Test du microbiome InnerBuddies, on obtient à la fois des perspectives macroscopiques et microscopiques. Cette approche intégrative est particulièrement utile dans les cas présentant à la fois des symptômes du haut du tube digestif et des déséquilibres ou inflammations microbiennes.

La récupération post-procédure comporte un léger inconfort pharyngé, et il est conseillé aux patients de ne pas manger ni conduire pendant plusieurs heures. Si des biopsies sont réalisées, les résultats peuvent prendre jusqu’à une semaine. Les patients présentant des symptômes persistants liés à l’acide, des ballonnements ou une sensation de satiété précoce peuvent grandement bénéficier de la combinaison de cette technique visuelle avec des tests fonctionnels intestinaux pour obtenir un diagnostic précis.

4. Dépistage par coloscopie : explorer le bas du système digestif

La coloscopie est un examen essentiel pour évaluer la santé du tractus gastro-intestinal inférieur, en particulier le côlon et le rectum. Elle est surtout connue pour sa capacité à dépister le cancer colorectal, mais elle est également extrêmement utile pour le diagnostic et la prise en charge de diverses affections digestives telles que la maladie de Crohn, la rectocolite hémorragique, la diverticulite et la diarrhée ou constipation chroniques.

Cette procédure consiste à insérer un long tube flexible muni d’une caméra dans le rectum pour examiner l’intérieur du côlon. La coloscopie est généralement réalisée sous sédation consciente et dure environ 30 à 60 minutes, selon les découvertes. Une préparation complète impliquant des restrictions alimentaires, des laxatifs et une hydratation est cruciale pour garantir une vision claire de la muqueuse colique.

La coloscopie permet de détecter :

• Polypes colorectaux : Qui peuvent être retirés avant de devenir cancéreux
• Inflammation : Indicative d’une MII comme la maladie de Crohn ou la rectocolite hémorragique
• Tumeurs ou croissances
• Anomalies vasculaires ou sources de saignement

Un autre avantage de la coloscopie est qu’elle permet des biopsies et le prélèvement microbien à partir de régions plus profondes du côlon. Bien que cela ne soit pas routinier en pratique clinique, le tissu colique peut être soumis au séquençage du microbiome dans des contextes de recherche ou des diagnostics étendus. Cela dit, les tests microbiens fécaux comme le Test du microbiome InnerBuddies sont plus accessibles et conviviaux pour les évaluations microbiennes générales.

La coloscopie est recommandée pour les personnes présentant :

• Des modifications persistantes du transit intestinal
• Du sang inexpliqué dans les selles
• Des douleurs abdominales chroniques associées à des ballonnements
• Un dépistage à partir de 45 ans pour le risque de cancer colorectal

La principale limitation de la coloscopie dans le contexte de la santé microbienne est qu’elle n’analyse pas la flore intestinale à moins d’y être spécifiquement dédiée. Cela dit, c’est un partenaire indispensable des tests du microbiome, en particulier lorsque l’inflammation ou des anomalies structurelles sont suspectées en parallèle de déséquilibres microbiens.

Un suivi approprié après une coloscopie — surtout si des polypes ou une inflammation ont été découverts — inclut l’adaptation de l’alimentation, des compléments et, dans certains cas, des probiotiques. C’est là que l’association des diagnostics structurels avec des tests fonctionnels comme le Test du microbiome InnerBuddies offre une vue complète pour les cliniciens et les patients.