16S rRNA contre le séquençage shotgun : quel test intestinal devez-vous choisir ?

Notre intestin abrite des milliards de microbes qui nous maintiennent en bonne santé de nombreuses façons—de l'aide à la digestion au soutien de notre système immunitaire. Comprendre ces petits auxiliaires vous donne une image plus claire de votre santé intestinale. Mais choisir le bon test intestinal est tout aussi important pour obtenir des informations précises et utiles.

Deux méthodes populaires sont le séquençage de l'ARNr 16S et les tests de selles par séquençage shotgun. Les deux utilisent la technologie de séquençage de l'ADN, mais elles fonctionnent de manière assez différente. Plongeons dans le fonctionnement de chacune et découvrons laquelle pourrait mieux répondre à vos besoins en matière de santé.

Comprendre le séquençage de l'ARNr 16S

Le séquençage de l'ARNr 16S se concentre sur un gène spécifique présent chez toutes les bactéries, appelé le gène de l'ARN ribosomique 16S. Ce gène agit comme une empreinte digitale pour les bactéries, permettant aux scientifiques d'identifier quels types vivent dans votre intestin.

Lorsque vous passez un test de séquençage de l'ARNr 16S, votre échantillon de selles est analysé pour lire ce gène dans toutes les bactéries présentes. Les résultats fournissent une ventilation des groupes bactériens dans vos intestins et leurs quantités relatives.

Un avantage de la séquençage 16S est son efficacité. C'est une méthode bien établie et rentable qui offre des informations fiables sur la diversité bactérienne. Pour beaucoup, cela suffit pour comprendre les schémas de base de la santé intestinale sans se ruiner.

Qu'est-ce que le séquençage métagénomique par shotgun ?

Les tests de selles par séquençage shotgun adoptent une approche plus large. Au lieu de se concentrer sur un seul gène, ils séquencent tout l'ADN présent dans l'échantillon — bactérien, viral, fongique, et même l'ADN humain mélangé.

Cela rend le séquençage métagénomique par shotgun plus détaillé. Il peut identifier les microbes jusqu'au niveau de l'espèce, voire de la souche, révéler des gènes liés à des fonctions comme le métabolisme, et détecter des microbes rares ou inconnus manqués par la méthode 16S.

En raison de cette profondeur, le séquençage par éclatement offre une image plus complète de l'écosystème de votre intestin. Il est particulièrement utile si vous souhaitez une compréhension avancée allant au-delà des seules bactéries ou si vous avez besoin d'explorer des conditions de santé spécifiques.

Comparer le séquençage 16S et le séquençage shotgun pour les tests intestinaux

Lorsque la précision et le détail sont vos principales préoccupations, le séquençage par shotgun est en tête de liste. Il couvre une plus large gamme de résidents du microbiome et met en évidence leurs rôles. Pendant ce temps, le séquençage 16S offre une vue d'ensemble solide des populations bactériennes mais ne parvient pas à différencier au-delà des groupes plus larges.

La couverture diffère également. Le séquençage 16S cible les communautés bactériennes, tandis que le séquençage métagénomique par tirage aléatoire capture l'ensemble du microbiote, y compris les champignons et les virus, qui peuvent également influencer votre santé intestinale.

Le coût et le temps sont également importants. Le séquençage 16S est généralement plus rapide et plus abordable, ce qui en fait un choix attrayant pour les bilans de santé intestinale de base. Le séquençage shotgun est plus coûteux et peut prendre plus de temps, mais il fournit des résultats plus complets pour ceux qui en ont besoin.

Quand choisir un test avancé du microbiote intestinal

Choisir entre le séquençage 16S et le séquençage shotgun dépend de vos objectifs en matière de santé. Si vous souhaitez avoir un aperçu simple des groupes bactériens dans votre intestin, le séquençage 16S est un excellent point de départ.

Cependant, si vous avez des problèmes intestinaux complexes, souhaitez une analyse détaillée des fonctions microbiennes ou avez besoin d'informations sur les populations virales ou fongiques, le séquençage métagénomique par tirage au sort est mieux adapté pour vous aider.

Les avancées dans la technologie de séquençage de l'ADN continuent d'améliorer les deux méthodes, apportant plus de précision et des résultats plus rapides. Cela signifie que même des tests de base comme le 16S deviennent plus fiables.

Comment InnerBuddies utilise la technologie de séquençage

Chez InnerBuddies, nous combinons le meilleur de ces technologies pour vous offrir des informations pertinentes. Notre test de microbiote utilise une technologie avancée de séquençage ADN conçue pour identifier avec précision les bactéries uniques de votre intestin. Nous proposons à la fois le séquençage métagénomique 16S et le séquençage métagénomique par shotgun sur notre plateforme.

Sur la base de vos résultats de séquençage, nous fournissons des conseils personnalisés adaptés à votre profil microbien spécifique. Cela vous aide à faire des choix alimentaires et de mode de vie qui soutiennent efficacement votre santé intestinale.

Faire le bon choix pour votre santé intestinale

Avant de choisir un test intestinal, réfléchissez à la raison pour laquelle vous souhaitez obtenir ces informations. Cherchez-vous une compréhension de base ou une analyse approfondie ? Le budget et le timing comptent également.

Consulter un professionnel de santé peut vous orienter vers la meilleure option. Il peut vous aider à interpréter les résultats et à proposer les prochaines étapes adaptées à votre bien-être.

Conclusion

Les tests d'analyse des selles par séquençage de l'ARNr 16S et par séquençage shotgun présentent chacun leurs avantages. Le séquençage 16S offre un moyen efficace de comprendre les communautés bactériennes, tandis que le séquençage shotgun fournit une image plus large et détaillée de l'ensemble de votre microbiote.

Passer un test intestinal, comme celui proposé par InnerBuddies, est une démarche intelligente pour améliorer votre bien-être. Comprendre votre microbiote unique vous aide à faire des choix éclairés pour une meilleure santé intestinale et une vitalité globale.

Commencez votre parcours dès aujourd'hui et découvrez comment le bon test intestinal peut vous débloquer une version plus saine de vous-même.