Mikrobiom-Sequenzierungstechniken: 16S bis Shotgun-Metaanalyse


Von 16S bis hin zu Shotgun-Metagenomik können Sie erforschen, wie die Sequenzierung des Mikrobioms funktioniert, Methoden vergleichen und den besten Ansatz für Ihre Forschung auswählen—klicken Sie hier, um einzutauchen. Das Verständnis der Techniken der Mikrobiom-Sequenzierung hilft, das Studiendesign an Ihre Ziele, Ihr Budget und Ihre Bearbeitungszeit anzupassen. Traditionelle Techniken der Mikrobiom-Sequenzierung wie die 16S-rRNA-Gen-Profile targeting Bakterien, während die Shotgun-Whole-Genome-Sequenzierung alles genetische Material in einer Probe analysiert, um taxonomische, funktionelle und sogar stamm-spezifische Informationen zu offenbaren. Ihre Wahl beeinflusst die nachgelagerte Analyse, die Dateninterpretation und mögliche Anwendungen. Die 16S-Sequenzierung ist eine kostengünstige Möglichkeit, eine große Anzahl von Proben zu untersuchen. Durch die Amplifikation eines kurzen Abschnitts des 16S-rRNA-Gens liefert dieser Ansatz schnelle mikrobielle Profile mit in der Regel Gattung- oder manchmal Art-level-Auflösung. Es erfordert vergleichsweise moderate Rechenressourcen und einfachere Pipelines, was es ideal für breite Gemeinschaftsuntersuchungen und erste explorative Studien macht. Allerdings bietet 16S begrenzte Einblicke in die Funktion und übersieht typischerweise nicht-bakterielle Mitglieder, sodass es keine direkten Informationen über metabolische Fähigkeiten oder präzise Stammunterscheidungen liefern kann. Wenn Ihre Forschung sich auf groß angelegte Verschiebungen in der Gemeinschaftszusammensetzung über viele Proben konzentriert, ist diese Mikrobiom-Sequenzierungstechnologie oft ein kluger Einstiegspunkt. Shotgun-Metagenomik bietet tiefere Einblicke mit höherer Auflösung. Durch die Sequenzierung des gesamten DNA in einer Probe ermöglicht sie taxonomische Zuordnungen auf Arten- oder Stamm-Ebene sowie direkte funktionelle Profilierung von Genen und Pfaden und umfasst Bakterien, Viren, Pilze und Archaeen. Dieser Ansatz eröffnet das funktionelle Potenzial und die metabolischen Interaktionen, was für Studien wertvoll ist, die das Mikrobiom mit Gesundheitszuständen, personalisierter Ernährung oder gezielten Probiotika-Strategien verbinden. Die Nachteile sind höhere Kosten, komplexere Bibliotheksvorbereitungen, größere Rechenanforderungen und eine erhöhte Anfälligkeit für Kontamination durch Wirts-DNA. Für Forschungsfragen zu Mechanismen und funktionalen Wegen ist Shotgun-Metagenomik häufig die bevorzugte Mikrobiom-Sequenzierungsmethode. Für Teams und Organisationen, die Programme für Darmgesundheit vorantreiben, bietet InnerBuddies eine leistungsstarke Plattform, um Sequenzierungserkenntnisse umzusetzen. Unser White-Label-Gut-Health-Operating-System ist modular und funktionsreich, entwickelt, um Ihre eigenen Mikrobiom-Testprodukte zu ermöglichen. Funktionen wie der Gut Microbiome Health Index (0–100)—unterstützt durch eine exklusive IP-Vereinbarung mit der EAFIT-Universität—sowie umsetzbare Einblicke in Bakterien-Alpha- und -Funktionalität helfen Ihnen, sich an einer gesunden Kohorte zu orientieren. Zielgruppenanalysen sowie personalisierte Ernährung- und Probiotika-/Prebiotika-Empfehlungen verwandeln Sequenzierungsergebnisse in praktische Hinweise, die auf gesundes Altern, Ausdauer-Sport, Haut- & Haargesundheit und mehr zugeschnitten sind. Um diese Fähigkeiten in Aktion zu sehen, besuchen Sie die InnerBuddies-Mikrobiom-Testseite: InnerBuddies Mikrobiom-Test, oder erfahren Sie mehr über den Zugang im Rahmen unserer Gut-Health-Mitgliedschaft. Wenn Sie eine Partner-gestützte Lösung in Betracht ziehen, kann unser B2B-Programm Ihnen helfen, gemeinsam mit Ihren Kunden Lösungen zu entwickeln: Werden Sie Partner von InnerBuddies.