microbiome assessment methods


Métodos de avaliação do microbioma: uma visão concisa

Os métodos de avaliação do microbioma são abordagens laboratoriais e computacionais que perfilam microrganismos, genes e metabolitos — normalmente a partir de amostras de fezes — para orientar decisões sobre a saúde intestinal. Estes métodos agrupam-se em composição (quem está presente), potencial funcional (quais genes e vias existem) e atividade/resiliência (o que os microrganismos estão a fazer agora ou ao longo do tempo). Técnicas comuns incluem a sequenciação do gene 16S rRNA para um perfil bacteriano económico, o shotgun metagenómico para resolução ao nível de espécie e gene, metatranscriptómica/metaproteómica para atividade, e metabolómica para produtos bioquímicos.

Quando a testagem é mais útil

  • Sintomas gastrointestinais persistentes e inexplicados: A testagem pode gerar hipóteses para discutir com o clínico.
  • Recuperação pós-antibióticos: Amostragens longitudinais ajudam a monitorizar a restauração da diversidade.
  • Monitorização personalizada: Estabelecer linhas de base e acompanhar respostas a alterações alimentares ou tratamentos.

A interpretação exige cautela: os dados do microbioma são, em grande parte, correlacionais e influenciados por antibióticos, dieta, manipulação da amostra e métodos laboratoriais. Instantâneos isolados têm limitações — dados longitudinais aumentam a confiança. Integre os resultados com o contexto clínico, registo de sintomas e testes confirmatórios quando surgirem sinais de alarme.

Para quem considera opções práticas, um teste de base do microbioma intestinal pode informar planos personalizados, enquanto um acompanhamento por subscrição apoia a monitorização longitudinal. Organizações que pretendam implementar programas de testagem podem explorar oportunidades de parceria numa plataforma B2B disponível.

Use os métodos de avaliação do microbioma como uma peça de evidência — combine os testes com orientação clínica, alterações de estilo de vida conservadoras e medições repetidas para fazer progressos mensuráveis e informados na saúde intestinal.

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Introdução aos métodos de avaliação do microbioma

Definição do termo e por que deve interessar

Os métodos de avaliação do microbioma são as técnicas laboratoriais e computacionais usadas para caracterizar as comunidades microbianas — bactérias, arqueias, fungos, vírus e os seus genes — tipicamente a partir de amostras de fezes, saliva ou pele. Estes métodos fornecem informação sobre a composição da comunidade (quais microrganismos estão presentes), o potencial funcional (que genes e vias metabólicas existem) e, por vezes, a atividade real (que metabólitos estão a ser produzidos). Para quem se interessa pela saúde intestinal, estes testes podem ajudar a clarificar se padrões microbianos se correlacionam com sintomas ou riscos e oferecem uma forma baseada em dados para acompanhar alterações.

Como este tema encaixa numa jornada prática de saúde intestinal

Na InnerBuddies, a saúde intestinal é encarada como um processo individualizado e mensurável. Os métodos de avaliação do microbioma podem fazer parte desse processo — especialmente quando os sintomas persistem apesar de avaliações rotineiras. Os testes são mais úteis quando integrados com contexto clínico, registo de sintomas e medições de seguimento para monitorizar respostas a alterações dietéticas, de estilo de vida ou a terapias médicas. Para quem procura testes estruturados e acompanhamento longitudinal, a InnerBuddies disponibiliza um teste do microbioma intestinal e opções de subscrição para rastreio contínuo.

Do interesse informativo à consciência diagnóstica

Muitos leitores começam por procurar informação sobre inchaço, alterações do trânsito intestinal ou alterações de humor. Os métodos de avaliação do microbioma ajudam a traduzir essa curiosidade em dados mensuráveis, mas não são diagnósticos autónomos. Os testes servem para orientar avaliações adicionais ou estabelecer linhas de base — não para substituir a avaliação médica. Conhecer o que cada método mede e as suas limitações é essencial antes de encomendar testes ou interpretar resultados.

Explicação central dos métodos de avaliação do microbioma

O que os métodos medem (composição, função e resiliência)

Os testes concentram-se tipicamente em três domínios sobrepostos:

  • Composição: Que táxons estão presentes e as suas abundâncias relativas (por exemplo, perfis a nível de género ou espécie).
  • Potencial funcional: A capacidade genética da comunidade — genes e vias metabólicas inferidas a partir do sequenciamento.
  • Atividade funcional ou resiliência: O que a comunidade está realmente a fazer, avaliado por sequenciação de RNA, proteómica, metabolómica ou amostragem repetida para estimar estabilidade e resposta a perturbações.

Principais tecnologias em prática

As principais técnicas laboratoriais são:

  • Sequenciação do gene 16S rRNA: Alvo de um gene marcador bacteriano para estimar a composição bacteriana a nível de género e, algumas vezes, espécie. É económico e muito usado, mas limitado na resolução funcional e nos membros não bacterianos.
  • Sequenciação metagenómica por shotgun: Sequenciação de todo o ADN numa amostra para identificar microrganismos a nível de espécie/estirpe e inferir conteúdo genético e vias metabólicas. Mais abrangente, mas mais caro e exigente em termos computacionais.
  • Metatranscriptómica e metaproteómica: Analisam ARN ou proteínas para medir expressão génica ativa, oferecendo perceção sobre quais as funções em curso no momento da amostragem.
  • Metabolómica: Perfilização de pequenas moléculas (ácidos gordos de cadeia curta, ácidos biliares, etc.) nas fezes ou no sangue para captar o produto funcional do microbioma.
  • Métodos baseados em cultura: Microbiologia tradicional que isola organismos vivos; útil para seguimento clínico, mas limitada para perfilar a comunidade completa.

Considerações práticas: tipos de amostra, timing e prazos

As fezes são a amostra mais comum para avaliação do microbioma intestinal; saliva, swabs cutâneos e biopsias são usados para outros nichos. O momento importa — antibióticos recentes, probióticos, alterações dietéticas, doença e menstruação podem alterar os resultados. Os prazos de entrega variam de dias a semanas conforme o laboratório e o método. A colheita correta, cadeia de frio ou soluções estabilizadoras e instruções claras ao utente são cruciais para obter dados úteis.

Por que os métodos de avaliação do microbioma são importantes para a saúde intestinal

Eixo microbioma–digestão–imunidade: como o equilíbrio influencia a função

O microbioma intestinal interage estreitamente com a digestão e o sistema imunitário. Os microrganismos ajudam a degradar carboidratos complexos, sintetizar vitaminas, metabolizar ácidos biliares e educar células imunitárias locais. Uma comunidade equilibrada apoia a extração de nutrientes e um tom imunitário mucoso regulado; a disrupção pode alterar a digestão, a função da barreira e a sinalização inflamatória. Os testes podem evidenciar desequilíbrios ou défices funcionais potencialmente relevantes para os sintomas.

Como os testes podem revelar condutores ocultos de sintomas intestinais

Muitos sintomas intestinais têm causas multifatoriais. Os testes do microbioma podem identificar padrões — diversidade reduzida, perda de grupos funcionais, sobrerrepresentação de patobiontes ou perfis de metabolitos alterados — que sugerem uma contribuição microbiana. Isto não prova causalidade, mas gera hipóteses a explorar com médicos ou nutricionistas e pode orientar intervenções dirigidas ou testes clínicos adicionais.

Sintomas, sinais e implicações para a saúde

Sintomas digestivos associados a padrões microbianos (inchaço, fezes irregulares, respostas alimentares)

Padrões comuns que podem refletir envolvimento microbiano incluem inchaço crónico, forma de fezes flutuante (prisão de ventre ou diarreia), gás e respostas semelhantes à intolerância alimentar. Alguns perfis microbianos (por exemplo, baixa diversidade de fermentadores ou sobrecrescimento de espécies produtoras de gás) podem associar-se a estas queixas, embora haja grande sobreposição e variabilidade.

Sinais imunitários, inflamatórios e metabólicos que podem refletir o estado do microbioma

Inflamação de baixo grau persistente, calprotectina fecal elevada ou marcadores metabólicos como perfis alterados de ácidos gordos de cadeia curta podem indicar processos relacionados com o microbioma. Algumas condições crónicas associadas a disbiose incluem perturbações funcionais intestinais e alterações metabólicas, mas os resultados devem ser interpretados no contexto clínico.

Sinais extra-intestinais: humor, energia, pele e alergias

O microbioma intestinal produz metabolitos e moléculas de sinalização que podem influenciar o humor, o sono, a saúde da pele e respostas imunitárias sistémicas. Existem associações entre padrões microbianos e condições como eczema, transtornos do humor e fadiga crónica — todavia, estas ligações são complexas e não são diagnósticas por si só.

Variabilidade individual e incerteza

Diferenças interindividuais na linha de base e o que isso significa para a interpretação

O microbioma de cada pessoa é moldado pela genética, eventos na primeira infância, dieta, ambiente e historial de medicação. Os intervalos “normais” são amplos; um perfil que é saudável para uma pessoa pode ser atípico para outra. Esta elevada variabilidade limita a utilidade de faixas de referência universais.

Variabilidade intraindividual ao longo do tempo (dieta, antibióticos, stress, doença)

O microbioma muda em horas a meses em resposta à dieta, antibióticos, viagens, sono, stress e infeções. Testes pontuais capturam um instantâneo; medições repetidas oferecem uma imagem mais clara da estabilidade, tendências e respostas a intervenções.

Variabilidade técnica e metodológica que influencia os resultados

Diferentes laboratórios usam vários métodos de extração, plataformas de sequenciação e pipelines bioinformáticos. Estas escolhas metodológicas podem influenciar a resolução taxonómica e a inferência funcional. A padronização está a melhorar, mas continua a ser um desafio — a interpretação deve ter em conta as referências e limitações específicas do laboratório.

Incerteza sobre a saúde intestinal e as limitações de adivinhar

Por que apenas os sintomas não revelam fiavelmente as causas

Muitos sintomas intestinais são inespecíficos e podem resultar de intolerâncias alimentares, distúrbios de motilidade, disfunção imunitária, patologias estruturais ou desequilíbrios microbianos. Apoiar-se apenas nos sintomas arrisca atribuições erradas e intervenções ineficazes.

O risco de assumir uma causa única para sintomas diversos

Assumir uma única causa — por exemplo, “bactérias más” — simplifica em excesso interações complexas entre hospedeiro e micróbios. Contribuintes múltiplos frequentemente coexistem; avaliação clínica e testes direcionados reduzem o risco de tratamentos inadequados ou desnecessários.

Valor de linhas de base personalizadas e dados em série temporal

Estabelecer uma linha de base pessoal e repetir testes após intervenções permite avaliar alterações significativas. Dados longitudinais são mais informativos para monitorizar recuperação após antibióticos, avaliar o impacto de mudanças dietéticas sustentadas ou acompanhar respostas a terapias médicas.

O papel do microbioma intestinal neste tema

Como o microbioma molda a função da barreira intestinal, inflamação e sinalização

Os microrganismos intestinais produzem metabolitos (por exemplo, ácidos gordos de cadeia curta) que reforçam a barreira intestinal, modulam respostas imunitárias locais e influenciam a sinalização enteroendócrina. A disrupção pode alterar a permeabilidade da barreira e ativar respostas imunitárias, contribuindo para a geração de sintomas e efeitos sistémicos.

Espécies-chave, redundância funcional e resiliência do ecossistema intestinal

Alguns microrganismos funcionam como espécies-chave com papéis funcionais desproporcionais. No entanto, muitas funções metabólicas são redundantes entre táxons — redundância funcional que confere resiliência. A perda de espécies-chave ou da diversidade global pode reduzir a resiliência e atrasar a recuperação após perturbações.

Como os desequilíbrios do microbioma podem contribuir

Mecanismos: permeabilidade aumentada, respostas imunitárias desreguladas e inflamação

Os desequilíbrios podem gerar metabolitos que enfraquecem as junções apertadas, estimulam vias imunitárias pró-inflamatórias ou reduzem a produção de compostos protetores. Estes mecanismos podem agravar sintomas ou perpetuar inflamação de baixo grau.

Efeitos na digestão, metabolismo de nutrientes e balanço energético

Enzimas microbianas influenciam a fermentação de carboidratos, a transformação de ácidos biliares e a síntese de vitaminas. A capacidade microbiana alterada pode modificar a disponibilidade de nutrientes, a produção de gás e a extração de energia — fatores que afetam a forma das fezes, a flatulência e sinais metabólicos.

Metabólitos microbianos e os eixos intestino–cérebro–metabólicos

Metabólitos microbianos (por exemplo, ácidos gordos de cadeia curta, derivados do triptofano) interagem com vias neurais, endócrinas e imunitárias que ligam a função intestinal ao apetite, ao humor e à regulação metabólica. Testes que medem metabolitos podem clarificar estas ligações funcionais.

Como os testes do microbioma fornecem perceção

O que um teste do microbioma mede (taxonomia, genes, vias e função inferida)

Consoante o método, os relatórios descrevem composição taxonómica (quem está presente), conteúdo génico e vias metabólicas potenciais (o que poderiam fazer) e, por vezes, atividade funcional através da análise de ARN ou metabolitos (o que estão a fazer agora). Os relatórios incluem frequentemente métricas de diversidade, abundâncias relativas e pontuações preditivas de vias.

Timing e interpretação: quando os resultados são mais significativos

O teste é mais informativo quando é planeado de forma ponderada — após períodos de “washout” de antibióticos ou probióticos ao monitorizar recuperação, ou repetidamente ao avaliar o impacto de uma mudança dietética ou de estilo de vida sustentada. A interpretação é mais sólida quando combinada com registos de sintomas, avaliação clínica e testes de seguimento.

Limitações e contexto: correlação vs causalidade, sinais de doença vs saúde

Os dados do microbioma são, em grande parte, correlacionais. Uma diferença taxonómica associada a sintomas não prova que a causa é essa. Alguns padrões microbianos são marcadores de processos patológicos em vez de condutores diretos. A integração clínica é necessária para traduzir resultados em ações seguras e baseadas em evidência.

Integração dos resultados com avaliação clínica para uma perspetiva completa

O envolvimento de um médico garante que os resultados sejam ponderados juntamente com análises laboratoriais, imagiologia e exame físico. Nutricionistas, gastroenterologistas ou especialistas em doenças infeciosas podem ajudar a priorizar intervenções, recomendar testes confirmatórios e monitorizar desfechos.

O que um teste do microbioma pode revelar neste contexto

Abundância relativa, índices de diversidade e previsões de vias funcionais

Os relatórios normalmente incluem medidas como diversidade alfa (diversidade dentro da amostra), diversidade beta (comparação com populações de referência) e listas de táxons predominantes. As previsões funcionais estimam a abundância de vias relacionadas com fermentação, metabolização de ácidos biliares ou genes de resistência a antibióticos.

Biomarcadores potenciais para saúde intestinal e padrões persistentes

Alguns padrões — diversidade reduzida, baixos níveis de produtores de butirato ou enriquecimento de táxons associados à inflamação — surgem recorrentemente na investigação. Não são diagnósticos, mas podem ser monitorizados como parte de uma avaliação mais ampla.

Acompanhamento longitudinal: estabelecer uma linha de base pessoal e observar mudanças

A repetição de testes permite avaliar se uma intervenção modifica o perfil para um padrão mais resiliente ou apenas causa alterações transitórias. Dados longitudinais ajudam a distinguir tendências relevantes da variabilidade diária.

Traduzir resultados em passos práticos (ajustes dietéticos, mudanças de estilo de vida, orientação clínica)

As ações informadas pelos testes devem ser conservadoras e baseadas em evidência: aumentar a variedade de fibras na dieta, eliminar desencadeantes óbvios, optimizar sono e gestão do stress, e tratamentos médicos orientados por clínicos quando indicados. Os laboratórios também podem indicar quando se justificam testes clínicos complementares (por exemplo, para patógenos ou inflamação).

Quem deve considerar o teste do microbioma

Indivíduos com sintomas gastrointestinais persistentes não explicados por testes padrão

Quando a avaliação gastrointestinal rotineira (análises sanguíneas, imagiologia, endoscopia quando indicada) não explica os sintomas e estes persistem, o teste do microbioma pode fornecer hipóteses adicionais e dados para que clínicos e nutricionistas atuem.

Recuperação após antibióticos ou planeamento pós-exposição a antibióticos

O teste pode documentar disrupção microbiana após antibióticos e fornecer uma linha de base para monitorizar recuperação, ajudando a orientar o momento ideal para reintroduzir fibras complexas ou probióticos sob supervisão profissional.

Condições crónicas com suspeita de envolvimento do microbioma (por ex., SII)

Pessoas com síndrome do intestino irritável, dispepsia funcional ou outras condições crónicas podem beneficiar de testes para elaborar planos de cuidado individualizados, embora os testes sejam complementares e não diagnósticos.

Pessoas que procuram um plano de saúde personalizado e progresso mensurável ao longo do tempo

Se valoriza a personalização orientada por dados e pretende fazer alterações dietéticas ou de estilo de vida sustentadas, testes de base e de seguimento podem quantificar mudanças e orientar refinamentos. A InnerBuddies oferece opções de assinatura de saúde intestinal para monitorização longitudinal.

Apoio à decisão: quando faz sentido testar o microbioma

Fluxo de decisão: avaliar sintomas, duração, urgência e testes prévios

Considere o teste quando os sintomas forem crónicos, a investigação prévia for inconclusiva ou quando necessitar de dados para orientar intervenções a longo prazo. Sintomas urgentes ou graves (perda de peso, hemorragia, febre) exigem cuidados médicos imediatos em vez de dependência exclusiva do teste do microbioma.

Passos práticos para preparar o teste (considerações pré-testes, dieta, medicação)

Siga as instruções do laboratório: evite antibióticos ou probióticos nos períodos de washout recomendados, mantenha a dieta habitual para uma avaliação de base e registe medicamentos ou doenças recentes. Metadados precisos melhoram a interpretação.

Interpretar resultados: sinais de alerta, perceções acionáveis e quando procurar um clínico

Relatórios podem assinalar potenciais patógenos ou genes de resistência — essas descobertas devem ser revistas por um clínico e, se necessário, confirmadas com testes adicionais. Use os resultados para orientar mudanças conservadoras e investigação clínica, em vez de tratamentos agressivos sem supervisão.

Custo, acessibilidade e cobertura de seguro

Grande parte dos testes do microbioma é paga pelo utente; a cobertura varia e os testes são frequentemente considerados experimentais. Avalie o custo face ao valor esperado da informação e discuta com o seu clínico.

Situações em que o teste é especialmente relevante ou não recomendado

O teste é relevante para sintomas crónicos e inexplicados ou para monitorização personalizada com fins de investigação. Não é recomendado como primeiro exame em sintomas agudos e graves nem como substituto de avaliações médicas indicadas.

Gestão da incerteza: enquadrar os resultados como dados orientadores, não diagnóstico definitivo

Considere os resultados do microbioma como uma peça do puzzle diagnóstico. Geram hipóteses e orientam monitorização, em vez de fornecer respostas definitivas. Procure interpretação profissional para evitar leituras excessivas de correlações.

Conclusão: ligar o tema ao entendimento do seu microbioma pessoal

Recapitulando incerteza, variabilidade e finalidade do teste

Os métodos de avaliação do microbioma oferecem perceções valiosas sobre composição microbiana e potencial funcional, mas estão sujeitos a grande variabilidade biológica e técnica. Os testes são mais úteis para informar do que para diagnosticar isoladamente.

Como usar o conhecimento do seu microbioma único para orientar os próximos passos

Combine os resultados com registos de sintomas, avaliação clínica e alterações conservadoras de estilo de vida. Repita testes quando justificável para confirmar tendências significativas e apoiar decisões colaborativas com profissionais de saúde.

Chamamento final: registe sintomas, considere o teste quando apropriado e envolva um profissional qualificado

Se está a registar sintomas intestinais persistentes ou a planear intervenções estruturadas, considere o teste como uma ferramenta informativa dentro de um plano guiado por clínicos. Para opções de teste e monitorização longitudinal, consulte o teste do microbioma intestinal e informações sobre como tornar-se parceiro na plataforma B2B.

Principais conclusões

  • Os métodos de avaliação do microbioma medem composição, potencial funcional e por vezes atividade; cada método tem pontos fortes e limites.
  • Sequenciação de fezes (16S e shotgun) e metabolómica são as abordagens mais informativas para perceções intestinais.
  • A elevada variabilidade inter e intraindividual significa que imagens pontuais são limitadas — dados longitudinais são mais úteis.
  • Os sintomas são inespecíficos; os testes podem revelar padrões microbianos ocultos, mas não provam causalidade.
  • Integre os resultados com avaliação clínica e registo de sintomas antes de implementar alterações significativas.
  • Os testes são mais apropriados para queixas gastrointestinais persistentes e inexplicadas, recuperação pós-antibiótico ou planos de monitorização personalizados.
  • Fatores metodológicos e pré-testes (antibióticos, dieta, manipulação da amostra) influenciam fortemente os resultados e a sua interpretação.

Perguntas frequentes

1. Qual é a diferença entre sequenciação 16S e metagenómica por shotgun?

A sequenciação 16S direciona-se a um gene marcador bacteriano para perfilar a composição bacteriana a nível de género ou resolução limitada de espécie e é mais económica. A metagenómica por shotgun sequencia todo o ADN, oferecendo maior resolução taxonómica, dados a nível de estirpe e conteúdo génico para inferência funcional, mas é mais cara e exige maior análise de dados.

2. Um teste do microbioma pode diagnosticar uma doença?

Não. Os testes atuais fornecem dados correlacionais e geradores de hipóteses. Não são diagnósticos por si só e devem ser usados juntamente com avaliação clínica e outros exames diagnósticos.

3. Quanto tempo depois de tomar antibióticos devo testar o meu microbioma?

Os antibióticos provocam disrupção significativa. Muitos laboratórios recomendam esperar várias semanas a meses — frequentemente 4–12 semanas — dependendo do antibiótico e do contexto clínico, para permitir alguma recuperação antes de realizar um teste de base.

4. Um único teste me dirá que dieta seguir?

Um único teste tem orientação limitada. Pode sugerir áreas a explorar (por exemplo, capacidade fermentadora baixa), mas as alterações dietéticas devem ser personalizadas, graduais e idealmente orientadas por um nutricionista ou clínico com testes de seguimento quando necessário.

5. Os testes baseados em metabolitos são melhores do que o sequenciamento?

Metabolómica e sequenciação são complementares. A sequenciação sugere potencial funcional enquanto a metabolómica mede saídas bioquímicas reais. Combinar abordagens fornece um retrato funcional mais completo, mas aumenta custo e complexidade.

6. Quão fiáveis são os relatórios do microbioma entre diferentes laboratórios?

A fiabilidade varia devido a diferenças no processamento de amostras, plataformas de sequenciação e bioinformática. Compare métodos e bases de referência usadas pelo laboratório e evite sobreinterpretar pequenas diferenças entre fornecedores.

7. Os testes podem ajudar após infeções recorrentes ou C. difficile?

Os testes do microbioma podem documentar disbiose e apoiar a decisão clínica, mas a gestão de infeções recorrentes geralmente requer testes dirigidos e tratamentos baseados em evidência por parte de clínicos, em vez de depender apenas dos dados do microbioma.

8. Pessoas saudáveis devem fazer testes do microbioma?

Pessoas saudáveis podem obter informação de base, especialmente se planeiam mudanças dietéticas importantes ou monitorização longitudinal, mas devem ponderar o custo e os limites atuais da aplicabilidade prática antes de testar.

9. Quais são sinais de alerta comuns num relatório do microbioma?

Achados como níveis elevados de patógenos conhecidos, abundância de genes de resistência a antibióticos ou marcadores de infeção ativa exigem revisão clínica e testes confirmatórios.

10. Como devo preparar-me para um teste de fezes?

Siga as instruções do laboratório — evite antibióticos e probióticos nos períodos de washout recomendados, mantenha a dieta habitual antes da colheita e registe medicamentos e doenças recentes para ajudar na interpretação.

11. Mudanças de estilo de vida podem alterar o meu microbioma de forma mensurável?

Sim. A dieta (especialmente a diversidade de fibras), exercício, sono e gestão do stress podem alterar a composição e função microbiana ao longo de semanas a meses. Os efeitos variam consoante o indivíduo e a intensidade da intervenção.

12. Como escolho um laboratório ou fornecedor de testes?

Escolha um fornecedor que descreva de forma transparente métodos, conjuntos de referência, limitações e que ofereça suporte de interpretação clínica. Avalie se existem opções de acompanhamento longitudinal e exportação de dados para análises futuras.

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