As vias metabólicas do Metacyc agrupam enzimas e reações em rotas definidas. Por exemplo, um passo transforma um nutriente em intermediário, que passa a ser a entrada para o próximo passo.
No intestino, os microrganismos utilizam estas vias para decompor carboidratos, proteínas e gorduras. Quando os microrganismos têm os substratos adequados, podem produzir metabólitos-chave que apoiam o funcionamento do intestino.
O Metacyc é também utilizado para ligar microrganismos a metabólitos. Isto ajuda a ligar “o que está no seu intestino” a “que trabalho metabólico está a acontecer”, o que é útil ao interpretar resultados de análises de microbioma.