Ultra przetworzone produkty są projektowane tak, aby były wygodne i wysoce smakowite. Często zawierają mniej naturalnego błonnika i więcej rafinowanych węglowodanów, dodanych cukrów i tłuszczów. To może podnosić poziom cukru we krwi szybciej i zmieniać sposób, w jaki jelita poruszają się i trawią pokarm.
W jelitach brak błonnika oznacza mniej „paliwa” dla korzystnych mikroorganizmów. Niektóre dodatki i emulgatory mogą również wpływać na środowisko jelit, co może zaburzać równowagę bakterii. Z czasem może to wpływać na trawienie, nawyki wypróżnień i rodzaje rosnących mikroorganizmów.
Kluczowym połączeniem z mikrobiomem jest to, że mikroorganizmy pomagają trawić pokarm i wspierają błonę jelitową. Kiedy dieta wielokrotnie zmienia skład mikroorganizmów, sygnały związane z zapaleniem i metabolizmem również mogą się zmieniać. Wyniki nie są takie same u każdego.