Kiedy jesz, niestrawione części pokarmu (takie jak błonnik i skrobia oporna) trafiają do jelita grubego. Bakterie jelitowe rozkładają je, przez co rośnie lub staje się bardziej aktywne które gatunki. Może to zajść w kilka godzin, zwłaszcza po posiłkach bogatych w fermentowalne węglowodany.
W miarę trawienia pokarmu przez mikroby powstają związki takie jak kwasy tłuszczowe o krótkim łańcuchu (SCFA). Te metabolity wspierają śluzówkę jelit, wpływają na sygnały zapalne i oddziałują na to, jak organizm przetwarza cukry i tłuszcze. Niektóre pokarmy również zmieniają kwasy żółciowe, co może dalej kształtować aktywność mikrobiomu.
Końcowy efekt to krótkotrwała zmiana trawienia, gazów, wzorców wypróżnień i czasem energii. Z biegiem czasu powtarzające się nawyki żywieniowe kształtują mikrobiom, co może czynić twoje odpowiedzi bardziej przewidywalnymi lub bardziej zmiennymi.