Microben in je darmen gebruiken enzymen om delen van voedsel te verteren die je eigen spijsverteringsenzymen niet aankunnen. Wanneer ze deze “microbe-vriendelijke” verbindingen afbreken, hebben ze energie en bouwstenen nodig, waardoor hun interne chemische routes worden aangedreven.
Veel microben geven de voorkeur aan specifieke brandstoffen, zoals voedingsvezels of bepaalde koolhydraten. Naarmate ze deze inputs metaboliseren, geven ze bijproducten af, waaronder korteketenvetzuren (SCFA) zoals acetaat, propionaat en butyraat, die de darmbarrière kunnen ondersteunen en nabijgelegen immuunsignalen kunnen beïnvloeden.
Het metabolisme van microben heeft ook invloed op galzouten en andere moleculen. Sommige microben kunnen galzuren transformeren, wat invloed kan hebben op hoe je lichaam vetten verwerkt en signaalprocessen met betrekking tot stofwisseling reguleert. Omdat de omstandigheden in de darmen van uur tot uur veranderen, kan microbieel actief veranderen afhankelijk van wat je eet.