Metacyc-paden bundelen enzymen en reacties in gedefinieerde routes. Bijvoorbeeld, één stap verandert een nutriënt in een intermediair, dat de invoer is voor de volgende stap.
In de darm gebruiken microben deze paden om koolhydraten, eiwitten en vetten af te breken. Wanneer microben de juiste substraten hebben, kunnen ze belangrijkste metabolieten produceren die de darmfunctie ondersteunen.
Metacyc wordt ook gebruikt om microben aan metabolieten te koppelen. Dit helpt om te verbinden wat er in je darmen zit met welk metabolisch werk er gebeurt, wat nuttig is bij het interpreteren van microbiome-gebaseerde labresultaten.