Next-gen darmtest: zo werkt DNA-sequencing van je microbioom
Een next-gen darmtest gebruikt next-generation sequencing (NGS) om DNA uit een ontlastingsmonster te analyseren. In plaats van alleen vooraf geselecteerde micro-organismen of één DNA-marker te onderzoeken, kan sequencing een breder profiel van het darmmicrobioom opleveren. Zo krijg je meer context over de samenstelling van het monster, maar geen medische diagnose.
In dit artikel lees je hoe DNA-sequencing werkt, wat het verschil is met 16S-sequencing en PCR, en hoe je de mogelijkheden en beperkingen van zo’n microbioomtest kunt beoordelen.
Ontdek de microbioom test
ISO-gecertificeerd EU-laboratorium • Monster blijft stabiel tijdens verzending • GDPR-veilige gegevens
Wat betekent next-gen?
‘Next-gen’ is een verkorte benaming voor next-generation sequencing. Dit is een groep laboratoriumtechnieken waarmee veel DNA-fragmenten parallel worden gelezen. Bij een darmtest wordt genetisch materiaal uit ontlasting gehaald en vervolgens vergeleken met een databank van bekende sequenties.
De precieze uitkomst hangt af van de gebruikte methode, de kwaliteit van het monster en de referentiedatabase. Sommige tests richten zich op het volledige genetische materiaal in het monster, terwijl andere een representatief deel daarvan analyseren. Daarom betekent ‘next-gen’ niet automatisch dat elk organisme of elke functie volledig wordt gemeten.
Bekijk voorbeeldaanbevelingen van het InnerBuddies-platform
Bekijk alvast de aanbevelingen voor voeding, supplementen, het voedingsdagboek en recepten die InnerBuddies kan genereren op basis van je darmmicrobioomtest
Hoe werkt een next-gen darmtest?
- Monster afnemen: je verzamelt een kleine hoeveelheid ontlasting volgens de instructies van het laboratorium.
- DNA isoleren: het laboratorium haalt genetisch materiaal uit het monster. Dat materiaal kan afkomstig zijn van meerdere soorten micro-organismen.
- Sequencen: DNA wordt in fragmenten gelezen met een sequencingtechniek.
- Analyseren: bio-informatica vergelijkt de gevonden sequenties met referentiedatabases.
- Rapporteren: je ontvangt doorgaans informatie over aangetroffen micro-organismen en soms over de mogelijke genetische functies die met die micro-organismen samenhangen.
Een functieprofiel beschrijft meestal een potentiële capaciteit op basis van DNA. Het bewijst niet dat een micro-organisme die functie op dat moment daadwerkelijk uitvoert. Ook geeft een ontlastingsmonster vooral informatie over het bemonsterde materiaal en niet over ieder deel van het spijsverteringskanaal.
Next-gen versus traditionele darmtesten
16S-sequencing
Bij 16S-sequencing wordt een specifiek onderdeel van het bacteriële 16S-rRNA-gen onderzocht. Omdat dit onderdeel tussen bacteriën verschilt, kan de methode een breed overzicht van bacteriële groepen geven. De resultaten zijn echter afhankelijk van de gekozen primers en analysemethode. Schimmels en virussen vallen doorgaans buiten een standaard 16S-test, en de methode geeft geen directe meting van de activiteit van bacteriën.
PCR-stoelgangtest
Een PCR-test zoekt gericht naar vooraf gekozen DNA-doelen. Dat kan nuttig zijn wanneer er een specifieke vraag is, bijvoorbeeld naar een bepaalde ziekteverwekker. PCR kan gevoelig zijn voor de doelen waarvoor de test is ontworpen, maar brengt niet automatisch het volledige microbioom in kaart.
2-minuten zelfcheck Is een darmmicrobioomtest nuttig voor jou? Beantwoord een paar korte vragen en ontdek of een microbioomtest echt nuttig is voor jou. ✔ Duurt slechts 2 minuten ✔ Gebaseerd op je klachten & leefstijl ✔ Duidelijke ja/nee aanbeveling Check of een test bij mij past →Wat voegt NGS toe?
NGS kan meer genetische informatie tegelijk analyseren dan een test die slechts enkele doelen onderzoekt. Afhankelijk van de uitvoering kan de methode daardoor een breder overzicht geven van de microbiële samenstelling en aanwijzingen geven over mogelijke genetische functies. Een bredere test is niet in elke situatie de beste keuze: voor een gerichte medische vraag kan een gevalideerde PCR- of andere laboratoriumtest geschikter zijn.
| Methode | Waar kijkt de test naar? | Belangrijke beperking |
|---|---|---|
| 16S-sequencing | Een marker in bacterieel DNA | Meestal geen schimmels of virussen; functionele informatie is beperkt |
| PCR | Vooraf gekozen DNA-doelen | Detecteert niet automatisch organismen die niet in het testpanel staan |
| NGS | Veel DNA-fragmenten tegelijk | Uitkomsten hangen af van laboratoriummethode, database en interpretatie |
Wat kun je uit een microbioomtest leren?
Een sequencingrapport kan onder meer informatie bevatten over:
- de relatieve aanwezigheid van bepaalde bacteriële groepen;
- de microbiële diversiteit die volgens de gekozen analysemethode is berekend;
- micro-organismen die met de gebruikte techniek en database konden worden herkend;
- mogelijke functionele eigenschappen die uit genetische informatie zijn afgeleid.
Deze gegevens kunnen helpen om je eet- en leefgewoonten beter te bespreken, maar ze bepalen niet zelfstandig welke voeding, probiotica of supplementen voor jou geschikt zijn. De samenstelling van het microbioom verschilt bovendien van persoon tot persoon en kan veranderen door onder meer voeding, medicatie, leeftijd en leefstijl.
Word lid van de InnerBuddies-community
Voer elke paar maanden een darmmicrobioomtest uit en volg je vooruitgang terwijl je onze aanbevelingen opvolgt
Wanneer kan een next-gen darmtest interessant zijn?
Een uitgebreide test kan interessant zijn als je meer wilt weten over de samenstelling van je microbioom of een brede, educatieve analyse zoekt. Let bij het vergelijken van tests op de volgende punten:
- welke sequencingmethode wordt gebruikt;
- of de test alleen bacteriën of ook andere micro-organismen analyseert;
- hoe het laboratorium de resultaten rapporteert en welke referentiedatabase wordt gebruikt;
- of het rapport duidelijk onderscheid maakt tussen gemeten gegevens en voorspellingen;
- hoe met je persoonsgegevens en biologisch materiaal wordt omgegaan.
Heb je aanhoudende, ernstige of toenemende klachten, bloed bij de ontlasting, onverklaarbaar gewichtsverlies, koorts of andere verontrustende symptomen? Bespreek die dan met een gekwalificeerde zorgprofessional. Een commerciële microbioomtest vervangt geen medische beoordeling of diagnostiek.
Veelgestelde vragen over next-gen
Wat is next gen?
Next gen verwijst meestal naar next-generation sequencing: een verzameling technieken waarmee veel DNA-fragmenten parallel worden gelezen. In een darmtest kan dit een breder microbioomprofiel opleveren dan een gerichte PCR-test of een standaard 16S-analyse.
2-minuten zelfcheck Is een darmmicrobioomtest nuttig voor jou? Beantwoord een paar korte vragen en ontdek of een microbioomtest echt nuttig is voor jou. ✔ Duurt slechts 2 minuten ✔ Gebaseerd op je klachten & leefstijl ✔ Duidelijke ja/nee aanbeveling Check of een test bij mij past →Wat zijn de reviews van The NextGen?
‘NextGen’ kan verwijzen naar verschillende producten, bedrijven of programma’s. Reviews zijn daarom alleen zinvol wanneer duidelijk is om welke aanbieder en welke test het gaat. Controleer bijvoorbeeld de gebruikte laboratoriummethode, de uitleg over privacy, de transparantie van het rapport en of medische claims goed worden onderbouwd. Een review is geen bewijs dat een test een diagnose kan stellen of gezondheidsklachten kan oplossen.
Wat is het NextGen-programma?
Het NextGen-programma is geen vaste, universele naam voor één darmtest. De term kan slaan op een programma van een bedrijf, onderzoeksgroep of zorgorganisatie. Kijk bij een specifieke aanbieder naar de officiële productbeschrijving om te zien wat ermee wordt bedoeld. In de context van het darmmicrobioom verwijst ‘next-gen’ vaak simpelweg naar sequencingtechnologie.
Samenvatting
Een next-gen darmtest kan met DNA-sequencing een breder beeld geven van het genetische materiaal in een ontlastingsmonster dan een gerichte PCR- of 16S-test. De uitslag is informatief, maar afhankelijk van de laboratoriummethode en niet hetzelfde als een diagnose. Gebruik het rapport als aanvullende informatie en bespreek medische klachten of opvallende resultaten met een zorgprofessional. InnerBuddies gebruikt sequencing om het microbioom in kaart te brengen.