Os micróbios no seu intestino carregam genes, mas não utilizam todos eles o tempo todo. Quando o ambiente muda, eles ativam ou desativam genes para produzir proteínas que desempenham funções específicas.
Esta mudança de expressão gênica é impulsionada por sinais como os nutrientes disponíveis, o pH, os níveis de oxigénio e a presença de outros micróbios. Por exemplo, quando comes mais fibra, os genes que digerem fibra podem tornar-se mais ativos, levando a mais fermentação e a subprodutos benéficos.
Em testes práticos, os investigadores podem estimar a atividade medindo o RNA microbiano (uma leitura de genes ativos) ou inferindo a atividade gênica a partir de mudanças na comunidade. O resultado mostra quais vias metabólicas têm mais hipóteses de estar a decorrer no teu intestino.