Por que são importantes as diretrizes internacionais para o teste do microbioma intestinal na prática clínica?

No dia 5 de dezembro de 2024, um grupo internacional de cientistas de microbiologia publicou a sua declaração de consenso internacional sobre testes de microbioma na prática clínica no The Lancet.ver ligação aquiEste artigo destinava-se a fornecer orientações internacionais sobre boas práticas de teste do microbioma intestinal para uso na prática clínica. Enquanto as evidências científicas continuam a aumentar sobre a grande importância dos microrganismos no microbioma intestinal e como eles se relacionam com muitos aspectos da saúde humana, os especialistas acreditam que a tecnologia do microbioma intestinal será cada vez mais utilizada na prática clínica. Assim, é importante estabelecer orientações internacionais para a utilização de testes do microbioma intestinal na prática clínica.

Como é que o teste InnerBuddies se compara a estas diretrizes internacionais?

InnerBuddies é uma empresa orientada para a ciência e somos uma spin-off da Universidade de Maastricht. Isso significa que estamos sempre focados em garantir que os nossos produtos estejam atualizados com os mais recentes conhecimentos e desenvolvimentos científicos. Por isso, obviamente, estávamos ansiosos por verificar o nosso produto existente face às diretrizes internacionais que foram estabelecidas por um grupo internacional de especialistas.

As diretrizes internacionais consistem em 35 declarações diferentes divididas em cinco grupos de trabalho distintos. A seguir, passaremos por todas as 35 declarações diferentes e explicaremos como a tecnologia InnerBuddies se adequa a todas essas declarações.

Como pode ver abaixo, a InnerBuddies cumpre integralmente 32 das 35 diretrizes e está parcialmente em conformidade com as restantes 3 diretrizes.

Grupo de trabalho 1: princípios gerais e requisitos mínimos para fornecer testes de microbioma

Este grupo de trabalho focou-se em princípios gerais e nalguns requisitos mínimos para o teste do microbioma.

Provedores de testes de microbioma devem comunicar uma representação razoável, fiável, transparente e científica do teste, tornando os clientes claramente conscientes da escassa evidência para a sua aplicabilidade na prática clínica

InnerBuddies está focado em:

• Incluindo apenas funcionalidades no seu painel e relatórios para as quais sentimos haver evidência científica suficiente. Todas as funcionalidades lançadas na nossa plataforma precisam de ser aprovadas por Koen Venema, um conhecido especialista internacional em microbiologia com mais de 30 anos de experiência, com formação pela Universidade de Wageningen, Universidade de Maastricht e TNO.
• Traduzir a linguagem científica para uma linguagem compreensível para consumidores comuns. Esta é exatamente a parte mais difícil do nosso trabalho, traduzir todo este material científico para uma linguagem que os clientes possam entender.
• Para uma utilização adequada na prática clínica, os testes ao microbioma intestinal devem aproximar-se de indicações médicas específicas. No entanto, actualmente ainda existem evidências limitadas (e precisão) para poder fazer isso. É por isso que o produto atual InnerBuddies está focado na população saudável e em tópicos gerais de saúde (e não em indicações médicas específicas).

Declaração 2: A prestação de um teste de microbioma envolve um quadro complexo, desde a recolha de amostras biológicas até à sequenciação do genoma microbiano e análises computacionais, até à emissão de um relatório interpretável. Portanto,
Os fornecedores de testes de microbioma devem incluir especialistas com competências multidisciplinares

Este é, na verdade, onde a equipa InnerBuddies tem um forte Ponto Único de Venda (USP), uma vez que a nossa equipa combina três disciplinas diferentes:

• Microbiologia, que é tudo sobre o conhecimento e a experiência em torno de testes laboratoriais
• Dietistas, que se trata de todo o conhecimento e expertise em torno de Alimentação & Nutrição & Saúde, mas também sobre como apresentar tudo aos consumidores para que eles possam entender o que estão a fazer e que os conselhos nutricionais sejam apresentados de uma forma acionável para os consumidores.
• Inteligência Artificial (IA), que neste caso trata-se de utilizar os Grandes Dados dos testes de ADN microbiológico para descobrir todas as informações incluídas nas sequências de ADN.

Declaração 3: Qualquer alteração na gestão clínica dos pacientes com base em testes de microbioma deve ser feita apenas pelos seus médicos responsáveis ou profissionais de saúde

Para a utilização clínica da InnerBuddies no teste do microbioma intestinal, refere-se à utilização de testes do microbioma intestinal relacionados com condições médicas específicas. Traduzimo-lo da seguinte forma:

• Separamos a "utilização para consumo" dos testes ao microbioma intestinal da "utilização por profissionais de saúde" dos testes ao microbioma intestinal. Atendemos ambos os tipos de clientes. Mas a nossa experiência também nos ensinou que os consumidores necessitam da informação de uma forma muito simples e acionável, enquanto os profissionais de saúde querem ver mais informações técnicas. É por isso que criaremos um módulo separado de "informação especializada" para profissionais de saúde, que inclui informações técnicas mais detalhadas sobre o teste ao microbioma intestinal.
• No nosso atual produto InnerBuddies não fornecemos qualquer avaliação relacionada com condições médicas do microbioma intestinal ou conselhos relacionados com condições médicas específicas. No entanto, a equipa InnerBuddies está a organizar ensaios clínicos independentes (com universidades) sobre condições médicas específicas, onde os conselhos de nutrição personalizados da InnerBuddies serão adaptados a condições médicas específicas. Após ensaios clínicos positivos, esta funcionalidade tem como objetivo tornar-se disponível em produtos separados, que estarão disponíveis através de reembolso ao abrigo do regulamento de dispositivos médicos para estas condições médicas específicas.

Declaração 4: Os laboratórios que fornecem testes ao microbioma intestinal devem garantir padrões de alta qualidade e proteção dos dados dos pacientes, e devem estar acreditados, registados e regulamentados.

Quando a InnerBuddies começou inicialmente, utilizámos o laboratório da Universidade de Maastricht. Atualmente, utilizamos dois laboratórios externos diferentes para os nossos testes ao microbioma intestinal. Ambos os laboratórios têm padrões de alta qualidade e estão acreditados e regulamentados. Com ambos os laboratórios temos acordos de processamento GDPR em vigor.

Declaração 5: São necessários pipelines de software computacional validados e atualizados, bem como bases de dados, destinados a delinear a taxonomia microbiana para fornecer testes de microbioma.

Este é, na verdade, um dos pontos mais fortes da equipa InnerBuddies, uma vez que temos tanto uma profunda especialização em microbiologia como em TIC e Inteligência Artificial na nossa equipa. Temos as seguintes coisas implementadas:

• Com os nossos dois laboratórios externos existentes, utilizamos duas tecnologias diferentes de sequenciação de ADN para testes do microbioma intestinal: Illumina MiSeq e Oxford Nanopore. Ambos os sequenciadores de ADN estão entre os mais avançados no teste do microbioma intestinal. O Illumina MiSeq permite uma taxonomia microbiana precisa até ao nível do Género, enquanto o sequenciamento completo 16S da Oxford Nanopore permite uma taxonomia microbiana precisa até ao nível da Espécie.
• Testámos múltiplos pipelines de cálculo diferentes para cada um destes sequenciadores de ADN com amostras simuladas para encontrar o melhor pipeline de cálculo (maior precisão em termos de encontrar as bactérias, mas também determinar a abundância correta de cada bactéria). Com base nestas comparações, podemos afirmar que temos os cálculos de taxonomia microbiana mais precisos atualmente disponíveis no mercado.
• Utilizamos a base de dados SILVA para a taxonomia microbiana. Esta base de dados também é utilizada por cientistas de todo o mundo, uma vez que atualmente é a melhor base de dados validada disponível para a taxonomia microbiana.
• Testámos ambos os nossos laboratórios externos com amostras simuladas para avançar para o processo de laboratório mais preciso para as nossas amostras. Por exemplo, é muito importante aplicar processos de laboratório específicos para garantir que tanto as bactérias gram-positivas como as gram-negativas sejam correctamente identificadas.

Grupo de trabalho 2: etapas processuais antes do teste

Este grupo de trabalho centra-se nas melhores práticas a aplicar antes de se realizar o teste real do microbioma intestinal.

Declaração 6: Como há poucas evidências da aplicabilidade dos testes ao microbioma intestinal na prática clínica, desencoraja-se o pedido direto pelos pacientes de testes ao microbioma sem uma recomendação clínica.

InnerBuddies reconhece que existem dois mercados para testes ao microbioma intestinal:

• Consumidores curiosos que desejam realizar testes ao microbioma intestinal para ver como é o seu microbioma intestinal. Estes consumidores também procuram aconselhamento nutricional personalizado, aconselhamento de diário alimentar personalizado e aconselhamento personalizado sobre probióticos e prebióticos. Em geral, estes consumidores fazem parte da população saudável e estão ansiosos para trabalhar na sua saúde geral preventiva.
• Testes através de profissionais de saúde (prática clínica). Estes são tipicamente clientes com condições médicas específicas que procuram uma solução para os seus problemas. É também por isso que eles falam com profissionais de saúde (HCP's). Os HCP's podem então decidir se um teste ao microbioma intestinal faz sentido para esse paciente em particular.

InnerBuddies não está a comercializar o seu teste de microbioma intestinal com base em condições médicas. Porque, de momento, há de facto ainda provas científicas limitadas para utilizar o teste do microbioma intestinal para condições médicas específicas. Esta decisão é deixada aos profissionais de saúde que podem fornecer aos pacientes recomendações clínicas.

Declaração 7: Antes do teste, devem ser recolhidos dados clínicos chave do paciente, incluindo aqueles que possam influenciar as características do microbioma intestinal; as informações essenciais a capturar devem incluir, pelo menos, idade, sexo, IMC, hábitos alimentares, estado de fumar e consumo de álcool, tempo de trânsito intestinal, comorbilidades e medicamentos, e antecedentes médicos passados.

Todos os clientes da InnerBuddies precisam de preencher um inquérito que inclui, de facto, perguntas sobre todos estes tópicos. Incluímos as respostas a todas estas perguntas também na geração do aconselhamento personalizado em termos de nutrição, diário alimentar ou probióticos e prebióticos.

Declaração 8: Os doentes não devem suspender a sua terapêutica ou alterar a sua dieta habitual antes do teste, a menos que recomendado pelo médico responsável.

Isto está correto, InnerBuddies não fornece qualquer recomendação sobre a suspensão de terapias existentes. InnerBuddies também não recomenda mudar as dietas antes do teste. Fornecemos recomendações de dieta e nutrição após realizar o teste. Fazemo-lo de várias maneiras:

• InnerBuddies fornece conselhos personalizados de diário alimentar. Isso é baseado no diário alimentar de 3 dias que os clientes preenchem, além das respostas às perguntas da pesquisa (este conselho não se baseia no teste do microbioma intestinal). Este produto gera conselhos linha por linha sobre o diário alimentar de 3 dias, semelhante ao processo normal dos nutricionistas. Como este conselho é baseado na dieta existente seguida pelo cliente, torna-se muito prático e acionável para o cliente acompanhar.
• O aconselhamento de nutrição personalizado da InnerBuddies baseia-se no teste do microbioma intestinal e nas respostas às perguntas do inquérito. Neste produto, recomendamos alimentos específicos que devem ser adicionados à dieta e alimentos específicos que devem ser evitados.

Declaração 9: A recolha de amostras de fezes deve evitar qualquer contaminação ambiental e garantir a preservação do genoma.

InnerBuddies centra-se na recolha de amostras com boa qualidade e estabilidade. Para este efeito, fazemos duas coisas específicas:

• No nosso kit de teste físico, incluímos todos os tipos de materiais que ajudam o consumidor a recolher facilmente a amostra de fezes na sanita. Isso inclui uma fita de recolha que pode fixar à sua sanita e com a qual pode capturar facilmente as fezes para que não caiam na água da sanita.
• Temos também um tubo que contém um fluido tampão para que o material recolhido se mantenha estável e com prazo de validade de aproximadamente 2 anos. A InnerBuddies está, na verdade, a trabalhar em conjunto com fornecedores para desenvolver líquidos tampão que mantenham a amostra estável por um período de tempo mais longo.

Declaração 10: As amostras recolhidas devem ser enviadas para laboratórios de testes com padrões de garantia para sequenciação do microbioma dentro dos prazos recomendados e condições descritas nas instruções dos kits de recolha. Uma vez chegadas, as amostras devem ser armazenadas a –80 °C até ao processamento posterior.

Ambos os nossos laboratórios externos armazenam todas as amostras recebidas de forma liofilizada (a -80 graus Celsius) aquando da sua chegada. Ambos os laboratórios possuem normas de garantia e estão acreditados. Ambos os laboratórios utilizam diferentes máquinas de sequenciação de ADN e os seus prazos de processamento são conforme os seus Acordos de Nível de Serviço (SLA's).

Declaração 11: A análise do microbioma a partir de amostras biológicas diferentes das fezes, incluindo esfregaços vaginais, cutâneos e orais, saliva e amostras de leite materno, deve ser processada de acordo com as evidências científicas existentes e as indicações clínicas.

Atualmente, a InnerBuddies processa apenas amostras de fezes (de excrementos), embora estejamos a trabalhar em ofertas multi-ômicas onde também processamos outros tipos de amostras. Em todos esses casos, claro que trabalharemos de acordo com as evidências científicas existentes e as indicações clínicas.

Grupo de trabalho 3: análise do microbioma

Este grupo de trabalho focou no processo laboratorial real e técnicas, bem como na parte de análise do microbioma intestinal.

Declaração 12: Métodos apropriados para o perfil da comunidade do microbioma intestinal incluem sequenciação de amplicões e sequenciação de genoma completo

InnerBuddies utiliza tecnologias de Sequenciação de Próxima Geração (NGS) e, especificamente, a sequenciação de amplicões da região 16S. Para o Illumina MiSeq, focamo-nos na região 16S V3/4, enquanto para a Oxford Nanopore, focamo-nos na região Full16S. Actualmente, também estamos a realizar alguns experimentos com Sequenciação Shotgun (sequenciação de genoma inteiro).

Embora os concorrentes às vezes utilizem técnicas como qPCR, PCR ouCitometria de fluxo (estas técnicas são geralmente mais baratas do que as técnicas de NGS), também são menos precisas e não fornecem uma visão completa da comunidade do microbioma intestinal. 

Declaração 13: A PCR multiplex e as culturas bacterianas, embora potencialmente úteis, não podem ser consideradas testes de microbioma nem podem ser usadas como um proxy para o perfil do microbioma.

Veja acima com a declaração 12. A InnerBuddies não utiliza técnicas como PCR Multiplex e culturas bacterianas. Utilizamos as técnicas mais caras (e mais precisas) de sequenciação de amplicões.

Declaração 14: O pré-processamento de dados sequenciados em bruto deve ser detalhado antes da análise

Na verdade, o InnerBuddies realiza todos os tipos de pré-processamento e filtragem antes de realizar a análise.

1. Remover os primers
2. Filtrar sequências de baixa qualidade
3. Filtrar sequências demasiado curtas ou demasiado longas
4. Realização de filtragem de quimera
5. Etcétera

Declaração 15: A análise do microbioma deve incluir métricas de diversidade alfa, incluindo riqueza e equitabilidade.

InnerBuddies fornece, de facto, métricas de diversidade alfa como o Índice de Shannon, a Igualdade de Pielou (evenness) e o número de OTUs (riqueza).

As métricas de diversidade alfa são as métricas mais importantes da qualidade do microbioma intestinal, uma vez que foram associadas a muitos indicadores de saúde em investigação científica.

Declaração 16: As medidas de diversidade beta devem ser incluídas na análise do microbioma

InnerBuddies utiliza uma coorte saudável que é basicamente uma forma de diversidade beta. Comparamos a abundância das 35 principais bactérias (as nossas bactérias-chave) com os intervalos saudáveis da coorte saudável. Isso compara a qualidade do microbioma intestinal em comparação com uma coorte de pessoas conhecidas por serem saudáveis e fornece orientações às pessoas onde a qualidade do seu microbioma intestinal pode potencialmente ser melhorada.

Declaração 17: Um perfil taxonómico completo das comunidades microbianas intestinais é um componente essencial dos testes de microbioma.

InnerBuddies realiza um perfil taxonómico completo das comunidades microbianas intestinais. É ainda possível para clientes ou profissionais de saúde descarregarem estes dados do nosso portal em formato CSV. Isto proporciona total transparência no perfil taxonómico completo da amostra de fezes.

Declaração 18: Deve ser incluída uma comparação apropriada com um grupo de controlo saudável correspondente nos testes de microbioma para auxiliar a interpretação do perfil taxonómico e de diversidade do paciente.

InnerBuddies corresponde ao perfil taxonómico e de diversidade a uma coorte saudável. Inicialmente, o InnerBuddies começou com uma coorte saudável que herdámos da Universidade de Maastricht. No entanto, após algum tempo, o InnerBuddies recolheu muito mais dados de clientes (com metadados estruturados), pelo que agora o InnerBuddies é capaz de atualizar periodicamente a sua coorte saudável com base na sua extensa base de dados.

InnerBuddies está agora também a avançar para uma coorte saudável para vias bacterianas. As vias bacterianas são mais estáveis entre regiões e continentes e proporcionarão até uma melhor base para a comparação de coortes saudáveis. Isso é ainda mais avançado e atualizado do que o que os especialistas em microbiologia, envolvidos nas diretrizes internacionais, estão a sugerir.

Declaração 19: Uma avaliação longitudinal do microbioma do paciente em diferentes momentos pode ser útil em cenários clínicos específicos

InnerBuddies permite que os seus clientes (e profissionais de saúde) realizem vários testes, efectuados em diferentes momentos, e os comparem uns com os outros. InnerBuddies também oferece subscrições anuais que incluem a realização de vários testes durante o ano. Isso permite que os clientes acompanhem os progressos que fizeram, seguindo o nosso aconselhamento personalizado de diferentes tipos.

A plataforma InnerBuddies contém uma funcionalidade extensa que permite uma comparação fácil e detalhada nestes diferentes testes.

Declaração 20: A análise metabolómica de biofluídos não é recomendada na prática clínica. Não se recomenda a inferência do "potencial metabólico" do microbioma do paciente através do seu perfil taxonómico.

A maioria da investigação científica nos últimos dois anos sobre o microbioma intestinal humano está focada nas funções metabolómicas das bactérias em vez de observar apenas a população bacteriana. Diferentes bactérias podem ter funções biológicas semelhantes. Isso é chamado de "potencial metabólico" do microbioma intestinal, uma vez que, ao observar as vias metabólicas, pode-se basicamente observar as funções biológicas realizadas pelas bactérias no microbioma intestinal.

Existem diferentes bibliotecas tecnológicas que podem ser utilizadas para calcular vias metabólicas. O InnerBuddies utiliza o PictRust2, que é a biblioteca mais respeitada e utilizada na maioria dos artigos de investigação científica. Existem dois tipos de sequenciação de ADN nos quais estas bibliotecas podem ser usadas:

• Sequenciação 16S (também chamada de sequenciação de amplicões)
• Sequenciação em espingarda

Abaixo, pode encontrar uma visão geral destes dois tipos de sequenciação.

Atualmente, a InnerBuddies utiliza o sequenciamento de amplicões 16S no seu produto. A razão é que este é o método mais preciso para o perfilamento de bactérias. Para o perfilamento funcional (previsão do potencial de vias metabólicas), o sequenciamento Shotgun é mais preciso, no entanto, este método é mais de 2 vezes mais caro do que o sequenciamento de amplicões 16S (o que aumentaria o preço do produto InnerBuddies por um fator 2).

A InnerBuddies esforça-se sempre pela melhor relação qualidade-custo nos seus produtos. Com base em investigação científica, sabemos que o perfil funcional do sequenciamento de amplicões 16S atinge cerca de 90% da precisão obtida com o perfil funcional do sequenciamento Shotgun. Embora, para a prática clínica, o preço real do produto de teste possa ser menos relevante, para a utilização pelo consumidor do produto InnerBuddies o preço é muito relevante (uma vez que os clientes têm de o pagar por si próprios).

Portanto, de uma perspetiva científica, o mais preciso seria utilizar o sequenciamento de amplicões 16S para o perfilamento das bactérias, enquanto se utiliza o sequenciamento Shotgun para o perfilamento funcional. No total, isso aumentaria o preço do produto InnerBuddies com um fator 3. InnerBuddies escolheu, portanto, utilizar o sequenciamento de amplicões 16S para ambos os fins, para manter o preço do produto a um nível baixo. Uma vez que a precisão do perfilamento funcional é cerca de 90% da precisão do sequenciamento Shotgun, este é para a InnerBuddies um compromisso aceitável.

Quando o produto InnerBuddies for utilizado na prática clínica (para indicações médicas específicas), isso pode levar-nos a incluir também o sequenciamento Shotgun dentro do produto. Uma vez que o produto de prática clínica provavelmente estaria coberto por reembolsos dos seguros de saúde, o equilíbrio em termos de qualidade versus custo seria diferente. Para fins de prática clínica, seríamos mais propensos a favorecer o sequenciamento Shotgun. A propósito, o InnerBuddies já está atualmente a utilizar o sequenciamento Shotgun para o seu negócio de microbioma de solos InnerSoils.

Grupo de trabalho 4: características dos relatórios

Este grupo de trabalho centrou-se no que são boas práticas na área da apresentação dos resultados e conselhos provenientes da análise do microbioma.

Declaração 21: Os dados relativos ao historial médico do paciente devem aparecer no relatório final.

O InnerBuddies apresenta as respostas ao questionário de inquérito como parte do painel de clientes.

Declaração 22: O relatório deve detalhar brevemente o protocolo de teste, incluindo métodos de colheita e armazenamento de fezes, extração de ADN, amplificação, sequenciação e análises pós-sequenciação.

Consideramos que este tipo de informação pertence à Propriedade Intelectual (PI) da InnerBuddies. Demorou muito tempo, custo e esforço para chegar a um fluxo de trabalho de análise do microbioma intestinal de alta e estável qualidade.

No entanto, para efeitos de prática clínica, entendemos que este tipo de informação é relevante para os profissionais de saúde. Assim que lançarmos os nossos produtos de prática clínica (com foco em condições médicas específicas), iremos, obviamente, incluir este tipo de informação.

Declaração 23: As medidas de diversidade alfa e beta avaliadas na fase de teste devem ser incluídas no relatório final.

InnerBuddies inclui ambos os tipos de dados, tanto no seu painel de cliente como nos seus relatórios em PDF.

Declaração 24: A composição do microbioma deve ser descrita com a resolução taxonómica mais profunda possível.

InnerBuddies fornece resolução taxonómica ao nível de género para os testes da região 16S V3/4 do Illumina MiSeq. Não fornecemos resolução ao nível de espécie para esta análise, uma vez que sabemos que não é suficientemente precisa (embora vejamos concorrentes a fornecerem isso com este tipo de tecnologia).

InnerBuddies fornece resolução taxonómica ao nível de espécie para os testes Full16S da Oxford Nanopore. Não fornecemos resolução ao nível de estirpe para esta análise, uma vez que sabemos que não é suficientemente precisa.

Os nossos clientes conseguem descarregar o perfil taxonómico completo em formatos CSV e Excel a partir do painel de clientes. Esta é uma funcionalidade bastante única, uma vez que a maioria das empresas de testes ao microbioma intestinal não disponibilizam esta opção.

Declaração 25: O relatório deve incluir todos os táxons que se desviam significativamente dos controles saudáveis compatíveis e dos agentes patogénicos microbianos conhecidos. A comunicação de táxons e aglomerados específicos relevantes para a saúde, independentemente da sua abundância, pode ser de interesse, apesar da escassa evidência de uma conexão causal com doenças humanas.

InnerBuddies inclui ambos os aspectos nos seus relatórios. A InnerBuddies está a utilizar as suas 35 principais bactérias importantes (bactérias-chave). Este top 35 foi estabelecido como sendo aquelas bactérias sobre as quais a ciência tem mais conhecimento disponível. A InnerBuddies dividiu estas bactérias em bactérias positivas, bactérias negativas e outras bactérias relevantes (a ciência sabe que estas outras bactérias relevantes são importantes, mas ainda não tem 100% de certeza se estas bactérias são boas ou más).

Todas as 35 principais bactérias são comparadas em termos de abundância com a nossa coorte saudável. Para cada bactéria entre as 35 principais, incluímos informações sobre o papel e a função dessa bactéria.

Declaração 26: Não se recomenda a comunicação da razão Firmicutes-para-Bacteroidetes nos testes de microbioma.

Embora muitas outras empresas de testes ao microbioma intestinal forneçam efectivamente esta proporção nos seus relatórios, a InnerBuddies decidiu não o fazer. É uma tradição bastante antiga incluir esta proporção específica e a ciência está atualmente ciente de que esta proporção não é realmente importante nem conclusiva.

Declaração 27: Não há evidências suficientes para incluir qualquer índice de disbiose no relatório de testes de microbioma, mas essas métricas justificam mais investigação.

Já vimos, de facto, outras empresas de testes ao microbioma intestinal fornecerem coisas como "Índice de Disbiose" ou "Índice Geral de Saúde Intestinal", basicamente tentando apresentar a saúde intestinal num número simples. Embora muitos cientistas estejam a trabalhar para encontrar um índice tão simples, atualmente não existe nenhum método geralmente aceite e correto de apresentar a saúde intestinal num número simples. Por isso, a InnerBuddies decidiu não incluir tal número no seu painel de clientes ou relatórios em PDF por enquanto. Embora estejamos a trabalhar com universidades em novas inovações que possam tornar possível um número tão simples de saúde intestinal.

Declaração 28: Geralmente, não há informações suficientes para reportar intervalos de referência saudáveis estritos de abundância relativa de espécies

Uma das melhores práticas mencionadas acima é utilizar uma coorte saudável (diversidade beta) para comparar a composição do microbioma intestinal da amostra de fezes com a coorte saudável. O InnerBuddies utiliza uma coorte saudável que é definida ao nível de "género", e não ao nível de "espécie". E é exatamente por causa desta diretriz, uma vez que não há informações suficientes para reportar níveis mínimo-máximo de uma coorte saudável com base nos níveis de abundância relativa de espécies.

Declaração 29: Recomenda-se a utilização de um infográfico intuitivo — por exemplo, gráficos de barras ou boxplots que mostrem as abundâncias relativas dos principais táxons — para tornar o relatório facilmente interpretável, enquanto as ordenações simples de táxons devem ser evitadas.

Desde a sua fundação em 2021, a InnerBuddies passou um tempo considerável a pensar sobre a melhor forma de apresentar as informações dos testes do microbioma intestinal aos seus clientes utilizando técnicas de visualização. Estamos efectivamente a utilizar visualizações infográficas para mostrar como a abundância de uma bactéria específica se compara com os intervalos saudáveis para essa bactéria.

Declaração 30: O painel desaconselha a comunicação de qualquer conselho terapêutico pós-teste pelo fornecedor do teste

O painel de especialistas indicou que ainda não há evidências suficientes para poder fornecer conselhos terapêuticos pós-teste com base nos testes do microbioma intestinal. No entanto, a InnerBuddies fornece três tipos de conselhos personalizados:

1. Aconselhamento nutricional personalizado
2. Aconselhamento de diário alimentar personalizado
3. Aconselhamento personalizado de probióticos e prebióticos

No entanto, a InnerBuddies fornece estes produtos de aconselhamento não apenas com base nos resultados do teste do microbioma intestinal, mas também nas respostas ao questionário de inquérito e no diário alimentar de 3 dias que os clientes preenchem. Na verdade, o aconselhamento personalizado do diário alimentar baseia-se principalmente no diário alimentar de 3 dias e não no teste do microbioma intestinal. Além disso, o aconselhamento personalizado sobre probióticos e prebióticos baseia-se mais no questionário de inquérito do que no teste do microbioma intestinal. Há uma razão simples para isso:

• A maioria dos probióticos foi clinicamente validada em funções específicas e grupos-alvo. Esta informação provém do questionário de inquérito e não do teste do microbioma intestinal.
• Muitas das estirpes bacterianas que foram clinicamente validadas são as chamadas "estirpes bacterianas sintéticas", o que significa que foram fabricadas em laboratório e não ocorrem naturalmente no microbioma intestinal. Portanto, um teste de microbioma intestinal normalmente não será capaz de medir essas estirpes bacterianas, a menos que o cliente tenha tomado recentemente essa estirpe probiótica específica como parte de um suplemento alimentar.

O aconselhamento nutricional personalizado da InnerBuddies baseia-se numa combinação de todas as 3 fontes de dados (questionário, diário alimentar de 3 dias e o teste do microbioma intestinal), mas, no que diz respeito à parte do microbioma intestinal, baseia-se fortemente em conjuntos de dados e algoritmos específicos que são propriedade da InnerBuddies. Estes não estão disponíveis para o domínio científico. A InnerBuddies está a trabalhar em conjunto com universidades, no entanto, para validar esses conjuntos de dados e algoritmos proprietários em ensaios clínicos. Assim que a pesquisa se tornar disponível em termos de publicações científicas, poderá encontrá-las neste website. Mas converter o teste do microbioma intestinal em aconselhamento nutricional personalizado é definitivamente inovador e a InnerBuddies é bastante única neste campo.

Declaração 31: Os dados brutos podem ser fornecidos ao paciente, a pedido (por exemplo, para uma análise de segunda opinião), sob a forma de amplicões ou leituras metagenómicas (com base no método de sequenciação).

Sim, a InnerBuddies permite que os seus clientes descarreguem o perfil taxonómico completo a partir do painel de cliente.

Grupo de trabalho 5: relevância do teste do microbioma na prática clínica: presente e futuro

Este grupo de trabalho focou principalmente na utilização futura dos testes ao microbioma intestinal na prática clínica.

Declaração 32: Não há evidências suficientes para recomendar amplamente a utilização rotineira de testes ao microbioma na prática clínica, o que deve ser apoiado por estudos dedicados.

Na verdade, actualmente o teste do microbioma intestinal não é amplamente utilizado na prática clínica. No entanto, dada a crescente evidência da importância da saúde do microbioma intestinal para a saúde humana, os especialistas esperam que o teste do microbioma intestinal se torne tão normal quanto um exame de sangue na prática clínica nos próximos 5 a 10 anos. A InnerBuddies quer estar na vanguarda deste desenvolvimento. Por isso, a InnerBuddies está a trabalhar activamente em conjunto com universidades para testar o seu algoritmo de personalização em ensaios clínicos, direccionados para condições médicas específicas.

Declaração 33: Dados qualitativos ou quantitativos recuperáveis de relatórios de microbioma podem ser úteis na gestão de várias perturbações, embora ainda haja evidências insuficientes para os aplicar na prática clínica

Isso está correto. No entanto, vários projetos de investigação estão a explorar a utilização clínica da análise do microbioma intestinal para condições médicas específicas. Por exemplo, a InnerBuddies está envolvida em estudos sobre Obesidade, SII, Stress e outras condições. Estes produtos, obviamente, só serão lançados após a disponibilidade de dados positivos de ensaios clínicos.

Declaração 34: São necessários estudos destinados a avaliar o valor do perfil do microbioma em diferentes distúrbios para permitir que os testes entrem na prática clínica

Sim, estão a ser realizados muitos estudos para avaliar a precisão da utilização de testes ao microbioma intestinal para "testar" doenças específicas, com a esperança de que se possam desenvolver testes que possam dar um aviso prévio para essas doenças.InnerBuddies, por exemplo, está envolvido em estudos sobre Obesidade, SII, Stress e outras condições. Estes produtos, obviamente, só serão lançados após a disponibilidade de dados positivos de ensaios clínicos.

Declaração 35: É defendida a divulgação dos potenciais benefícios e desvantagens dos testes de microbioma, bem como a formação sobre os conceitos básicos da ciência do microbioma e sobre a interpretação de relatórios de microbioma, para promover e disseminar a sua utilização na prática clínica.

Sim, a InnerBuddies está a trabalhar em conjunto com profissionais de saúde para os informar sobre os benefícios dos testes ao microbioma intestinal e sobre o que é cientificamente possível hoje em dia. A InnerBuddies continuará a fazê-lo assim que novas descobertas científicas estiverem disponíveis e estes tipos de testes forem utilizados mais amplamente na prática clínica.