Mikroorganizmy w twoim jelicie mają geny, ale nie wykorzystują ich wszystkich cały czas. Gdy środowisko się zmienia, włączają lub wyłączają geny, aby produkować białka spełniające konkretne zadania.
To przełączanie genów napędzane jest sygnałami takimi jak dostępność składników odżywczych, pH, poziom tlenu oraz obecność innych mikroorganizmów. Na przykład, gdy jesz więcej błonnika, geny trawiące błonnik mogą stać się bardziej aktywne, co prowadzi do większego fermentowania i pożytecznych produktów ubocznych.
W praktycznych badaniach naukowcy mogą oszacować aktywność poprzez pomiar RNA mikroorganizmów (odczyt aktywnych genów) lub na podstawie zmian w składzie społeczności mikrobiologicznej. Wynik pokazuje, które szlaki metaboliczne najprawdopodobniej działają w twoim jelicie.