IBS przede wszystkim wpływa na trawienie, ale może też wpływać na codzienne życie i ogólne zdrowie. Podczas napadów dolegliwości mogą osłabiać apetyt i sprawiać, że posiłki wydają się nieprzewidywalne, co może obniżać energię i zwiększać zmęczenie.
Z czasem utrzymujące się objawy mogą pośrednio wpływać na metabolizm. Hormony stresu i nieregularne odżywianie mogą zmieniać sposób, w jaki organizm przetwarza cukier we krwi i magazynuje tłuszcz. IBS zwykle nie powoduje uszkodzeń jelit, ale przewlekłe objawy mogą wpływać na sen, nastrój i długoterminowe samopoczucie.
Długoterminowe ryzyko zależy od osoby. IBS nie jest tym samym co choroba zapalna jelit, ale ważne jest wykluczenie innych schorzeń, gdy objawy się zaczynają, zmieniają lub nasilają.