Dysbioza może wpływać na samopoczucie na co dzień. Może wpływać na trawienie—na przykład wzdęcia, gazy lub nieregularne wypróżnienia—ponieważ błonnik i składniki odżywcze nie są przetwarzane tak skutecznie.
Może to także odgrywać rolę w metabolizmie. Mikroorganizmy, które produkują związki wspomagające energię i przekazywanie sygnałów, mogą się zmieniać, co może wpływać na to, jak organizm radzi sobie z cukrami i tłuszczami.
Długoterminowo dysbioza została powiązana z wyższym ryzykiem przewlekłych problemów jelitowych. To nie jedyna przyczyna, ale może być ważnym czynnikiem wpływającym, gdy utrzymuje się.