Jouw darmecosysteem bevat triljoenen microben (bacteriën, schimmels en anderen) plus de omstandigheden waarin ze leven. Hun balans hangt af van beschikbare voedingsstoffen, darmbeweging, zuurstofniveaus en de gezondheid van de darmlining. Deze omgeving bepaalt welke microben kunnen overleven en zich kunnen vermenigvuldigen.
Microben helpen bij het verteren van wat je niet volledig zonder hulp kunt afbreken, vooral vezels. Ze fermenteren bepaalde vezels tot kortketenvetzuren (SCFA's), die darmcellen voeden en een normale darmfunctie ondersteunen. Dit beïnvloed ook signalen die invloed hebben op metabolisme en immuunactiviteit.
Wanneer het ecosysteem in balans is, kunnen nuttige microben concurreren met schadelijke. Wanneer het verstoord is, kunnen minder nuttige microben toenemen en kan de fermentatie veranderen. Die verschuiving kan symptomen zoals een opgeblazen gevoel en regelmaat beïnvloeden, en op lange termijn de gezondheid beïnvloeden.