La fermentation transforme les sucres ou les protéines présents dans les aliments en de nouveaux composés. Les résultats courants incluent l'acide lactique, l'acide acétique, le dioxyde de carbone et l'alcool. Ces transformations peuvent améliorer la saveur et la conservation tout en facilitant l'absorption des nutriments pour certaines personnes.

De nombreux aliments fermentés contiennent des microbes vivants, tandis que d'autres fournissent principalement des “restes microbiens” comme des acides organiques et des enzymes. La digestion de votre estomac et de votre intestin grêle réduira certains microbes vivants, mais les composés qu'ils laissent derrière eux peuvent encore influencer l'environnement de votre intestin.

Dans le côlon, ces composés peuvent influencer quels microbes se développent le mieux. Cela peut aider à faire passer l'équilibre vers des organismes qui soutiennent la digestion et la fonction de la barrière intestinale, bien que les réactions varient selon les individus.