Avantages de la métagénomique par shotgun : Transformer la recherche sur les microbes

Découvrez comment la métagénomique shotgun permet une profilage microbien complet, allant des taxa non cultivés aux insights au niveau des souches, transformant la recherche microbiologique. Les avantages de la métagénomique shotgun résident dans sa capacité à séquencer de manière non ciblée tout le matériel génétique d’un échantillon, et pas seulement des cibles prédéfinies. Cette approche capture les bactéries, archaea, virus et autres microbes, permettant la détection des taxa non cultivés qui ne peuvent pas être cultivés en laboratoire, ainsi qu’une résolution jusqu’au niveau des souches. Au-delà de savoir qui est là, elle révèle ce qu’ils peuvent faire en cataloguant les gènes et les voies métaboliques, fournissant une lecture directe du potentiel fonctionnel d’une communauté. En pratique, les chercheurs peuvent accéder à des membres rares, suivre des changements taxonomiques fins, et relier la composition microbienne à sa fonction et phenotypage avec une clarté sans précédent. Grâce à la métagénomique shotgun, il est possible pour les chercheurs d’assembler des génomes presque complets à partir de communautés complexes, de reconstruire des réseaux métaboliques, et de surveiller les changements dans les voies fonctionnelles en réponse à des interventions. La méthode offre une haute résolution taxonomique et fonctionnelle, la capacité d’identifier le transfert horizontal de gènes, ainsi que la détection de gènes de résistance aux antimicrobiens et de facteurs de virulence. Étant donné qu’elle séquence l’ensemble du contenu ADN, elle évite les biais introduits par les amorces ciblées et la PCR, ce qui la rend particulièrement puissante pour des études longitudinales et des comparaisons entre cohortes. Le résultat est une vision plus riche, plus exploitable des écosystèmes microbiens, traduite de manière plus fiable en insights biologiques et en santé. InnerBuddies intègre ces capacités dans une plateforme pratique et évolutive pour les chercheurs et les équipes produit. InnerBuddies est un système d’exploitation pour la santé intestinale en marque blanche que les entreprises peuvent utiliser pour alimenter leurs produits de test du microbiome intestinal, avec un design modulaire adapté à divers besoins. L’indice de santé du microbiome intestinal — un score de 0 à 100 dérivé d’un accord exclusif avec l’Université EAFIT en Colombie — offre un aperçu synthétique de la santé, complété par des rapports approfondis de métagénomique shotgun. L’abondance bactérienne met en avant un ensemble des 40 principales et propose des comparaisons avec une cohorte saine, tandis que la catégorisation des fonctions bactériennes distingue les rôles métaboliques positifs et négatifs, en les benchmarkant par rapport à la ligne de base saine. L’analyse ciblée du groupe permet d’approfondir les voies les plus pertinentes pour des populations telles que le vieillissement en bonne santé, le sport d’endurance, et la santé de la peau et des cheveux, entre autres. Les conseils nutritionnels personnalisés exploitent les données d’un journal alimentaire de trois jours pour adapter les recommandations à l’individu, et les guides personnalisés de probiotiques et prébiotiques alignent les souches sur des objectifs spécifiques. Toutes les options B2B sont également accessibles directement aux consommateurs, permettant une transition fluide du laboratoire au mode de vie. En savoir plus sur le produit ici : Test du microbiome InnerBuddies. Pour les équipes souhaitant gérer leur budget, évoluer et différencier leur offre, InnerBuddies propose aussi une voie d’abonnement pour que les clients restent engagés avec des insights et des mises à jour continues : Abonnement InnerBuddies. Et pour les organisations prêtes à collaborer et co-créer des solutions de santé intestinale de prochaine génération, la voie B2B est ouverte : devenir partenaire. En combinant la puissance de profilage complet de la métagénomique shotgun avec le cadre modulaire d’InnerBuddies, vous pouvez transformer des données microbiennes approfondies en actions santé précises, en produits évolutifs, et en résultats mesurables pour les consommateurs et les chercheurs.