Mis à jour:

Microbiote intestinal et microbiome : quelle différence ?

La différence entre le microbiote intestinal et le microbiome tient surtout à leur portée. Le microbiote désigne les micro-organismes présents dans l’intestin, tandis que le microbiome englobe ces organismes, leurs gènes et leurs fonctions au sein de leur environnement. Cet article présente des définitions simples, un tableau comparatif et des conseils généraux pour soutenir cet écosystème par l’alimentation et le mode de vie.
What is the difference between gut microbiota and gut microbiome

La différence entre le microbiote intestinal et le microbiome est simple à retenir : le microbiote désigne la communauté de micro-organismes présents dans l’intestin, tandis que le microbiome renvoie à un ensemble plus large comprenant ces micro-organismes, leurs gènes et leurs fonctions. Cette distinction aide à mieux comprendre les études sur la santé digestive et les résultats des analyses du microbiome.

Une image peut aider : le microbiote correspond aux habitants d’une ville ; le microbiome comprend les habitants, leurs compétences, leurs activités et l’environnement dans lequel ils évoluent.


Qu’est-ce que le microbiote intestinal ?

Le microbiote intestinal est la communauté de micro-organismes qui vivent dans le tube digestif, notamment dans le côlon. Il comprend de nombreuses bactéries, mais aussi des archées, des champignons et des virus. Sa composition varie d’une personne à l’autre et peut évoluer au fil du temps.

Cette composition est influencée par plusieurs facteurs, notamment l’alimentation, l’environnement, l’âge, le mode de vie et certains traitements. Il n’existe donc pas une composition unique qui conviendrait à tout le monde. La diversité et l’équilibre du microbiote sont étudiés parce qu’ils peuvent être associés au fonctionnement digestif et à d’autres aspects de la santé, sans permettre à eux seuls de poser un diagnostic.

Qu’est-ce que le microbiome intestinal ?

Le microbiome intestinal désigne un concept plus large. Selon le contexte scientifique, il peut désigner l’ensemble des micro-organismes et de leur matériel génétique, ainsi que l’écosystème et les fonctions associés. Le terme met donc davantage l’accent sur le potentiel et l’activité de cette communauté.

Les chercheurs peuvent par exemple étudier la manière dont les micro-organismes utilisent les fibres alimentaires, produisent certains composés ou interagissent avec leur environnement. Ces observations décrivent des mécanismes et des associations ; elles ne signifient pas qu’un résultat suffit à expliquer l’état de santé d’une personne.

Microbiote intestinal ou microbiome : tableau comparatif

ÉlémentMicrobiote intestinalMicrobiome intestinal
DéfinitionCommunauté de micro-organismes vivant dans l’intestinMicro-organismes, matériel génétique, fonctions et environnement associés
Ce qui est étudiéLes organismes présents et leur compositionLa composition, les gènes, les interactions et le potentiel fonctionnel
PortéePlus ciblée : les habitants de l’écosystèmePlus large : l’écosystème et son fonctionnement
Image à retenirLes habitants d’une villeLa ville, ses habitants, ses activités et ses réseaux

Pourquoi cette différence est-elle utile ?

Deux personnes peuvent avoir des espèces microbiennes différentes tout en présentant certaines fonctions microbiennes comparables. À l’inverse, une composition qui semble similaire ne permet pas nécessairement de conclure que les fonctions sont identiques. C’est pourquoi les recherches distinguent souvent la composition du microbiote et les fonctions du microbiome.

Un test du microbiome peut fournir des informations sur les micro-organismes détectés ou sur certaines caractéristiques analysées. Toutefois, ses résultats doivent être interprétés avec prudence : ils ne constituent pas un diagnostic et ne remplacent pas l’avis d’un professionnel de santé, surtout en présence de symptômes persistants ou préoccupants.

Comment soutenir son microbiote intestinal au quotidien ?

Les habitudes suivantes peuvent contribuer au bien-être digestif général, sans garantir un résultat identique pour chaque personne :

  • Varier les sources de fibres avec des légumes, fruits, légumineuses, noix, graines et céréales complètes, en adaptant progressivement les quantités à sa tolérance.
  • Boire suffisamment et maintenir une alimentation globalement équilibrée.
  • Inclure éventuellement des aliments fermentés, comme le yaourt, le kéfir ou certains légumes fermentés, si vous les tolérez et s’ils s’intègrent à votre alimentation.
  • Favoriser un mode de vie régulier, avec un sommeil suffisant, une activité physique adaptée et des stratégies de gestion du stress.

En cas de maladie, de régime particulier, de grossesse ou de traitement en cours, demandez conseil à un professionnel de santé avant de modifier fortement votre alimentation ou de prendre un complément.

Questions fréquentes

Le microbiote et le microbiome sont-ils des synonymes ?

Ils sont parfois employés comme des synonymes dans le langage courant, mais leur sens n’est pas exactement le même. Le microbiote désigne principalement les micro-organismes eux-mêmes. Le microbiome a généralement une portée plus large, incluant leur matériel génétique, leurs fonctions et leur environnement. La définition peut toutefois varier légèrement selon les publications.

Lequel est le plus important : le microbiote ou le microbiome ?

Il n’est pas pertinent de les opposer. Le microbiote représente la communauté microbienne, tandis que le microbiome permet d’étudier cette communauté dans son ensemble et ses fonctions potentielles. Pour comprendre l’écosystème intestinal, les deux notions sont complémentaires.

Les probiotiques agissent-ils sur le microbiote ou le microbiome ?

Les probiotiques sont des micro-organismes vivants présents dans certains aliments ou compléments. Ils peuvent influencer temporairement l’écosystème intestinal chez certaines personnes, mais leurs effets varient selon la souche, la dose et le contexte. Ils ne conviennent pas nécessairement à tout le monde et ne remplacent pas un avis médical ni un traitement prescrit.

Quand consulter un professionnel de santé ?

Consultez un professionnel de santé si vos troubles digestifs sont persistants, importants, s’aggravent ou s’accompagnent de signes préoccupants. Une analyse du microbiome ne doit pas être utilisée seule pour interpréter ces symptômes ou choisir un traitement.

À retenir

Le microbiote intestinal correspond aux micro-organismes présents dans l’intestin. Le microbiome intestinal englobe généralement ces organismes, leurs gènes, leurs fonctions et leur environnement. Comprendre cette nuance permet de mieux lire les informations sur la diversité microbienne et la santé digestive. Une alimentation variée et un mode de vie équilibré peuvent soutenir le bien-être général, mais les recommandations doivent être adaptées à chaque situation.

Voir tous les articles du Les dernières actualités sur la santé du microbiote intestinal