Opções de Sequenciamento do Microbioma: Um Guia Rápido para Escolher o Método Certo


Ao considerar opções de sequenciamento do microbioma, os investigadores geralmente avaliam o sequenciamento do gene 16S rRNA, a metagenómica shotgun e os painéis de sequenciamento direcionado. O sequenciamento do gene 16S rRNA é acessível e rápido, excelente para sondar a composição bacteriana geral, mas geralmente limitado à resolução ao nível de género e carece de dados funcionais diretos. A metagenómica shotgun sequencia todo o DNA de uma amostra, possibilitando uma taxonomia ao nível de espécie — e, por vezes, de estirpe — além de fornecer insights sobre vias metabólicas, mas com custos mais elevados e análises de dados mais exigentes. Os painéis de sequenciamento direcionado oferecem um meio-termo, focando em genes ou vias previamente definidos para equilibrar o custo com informações funcionais acionáveis. A sua escolha deve alinhar-se com se o seu objetivo é perfil taxonómico, inferência funcional ou ambos, bem como com o seu orçamento e escala do projeto. Custos e precisão variam entre estas opções de sequenciamento do microbioma. O sequenciamento do 16S pode custar alguns euros por amostra ao processar grandes quantidades, enquanto a metagenómica shotgun pode custar significativamente mais por amostra devido à profundidade de sequenciamento e às necessidades de processamento de dados. A precisão depende da profundidade de leitura, bases de dados de referência e escolhas de pipeline; a shotgun fornece dados mais ricos, mas requer um controlo de qualidade cuidadoso e suporte de bioinformática. Ao planear um estudo, clarifique as questões que deseja responder (quem está presente, o que estão a fazer e como isso se relaciona com a saúde ou resultados do produto), a resolução necessária e como os resultados serão utilizados em contextos clínicos, de consumo ou de investigação. Para transformar as opções de sequenciamento do microbioma num produto prático, a InnerBuddies oferece um Sistema Operacional de Saúde Intestinal de marca branca, concebido para impulsionar o seu programa de testes de microbioma. A plataforma inclui um Índice de Saúde do Microbioma (0–100), baseado num acordo exclusivo de PI com a Universidade EAFIT na Colômbia, além de Abundâncias de Bactérias para os 40 principais táxons com benchmarking de coortes saudáveis e Funções de Bactérias categorizadas e rotuladas como positivas ou negativas. Também fornece Análise de Grupo-Alvo para domínios como Envelhecimento Saudável, Desporto de resistência e Saúde da pele e cabelo, juntamente com aconselhamento de Nutrição Personalizada e recomendações de probióticos e prebióticos personalizadas, baseadas em dados de dieta e fezes. A InnerBuddies atende tanto a soluções de teste de microbioma para consumidores como parcerias B2B, com todas as opções B2B também acessíveis diretamente aos consumidores. Saiba mais sobre a sua solução de teste de microbioma na página do produto aqui: Página do produto de teste de microbioma da InnerBuddies. Para equipas que avaliam como implementar opções de sequenciamento do microbioma em escala, considere combinar a geração de dados com uma plataforma que traduza os resultados em ações práticas. Se estiver a explorar uma rota de marca branca ou um programa pronto para consumidores, verifique as oportunidades de B2B da InnerBuddies ou os serviços de adesão: Página B2B da InnerBuddies e Adesão à Saúde do Intestino da InnerBuddies.