Wat is bacteriële abundantie en wat betekenen de resultaten van onze studie?

Bij het lezen van darmmicrobioomtestresultaten kom je vaak de term 'bacteriële abundantie' tegen. Dit artikel legt uit wat deze term inhoudt en hoe wij deze meten. Daarnaast delen we de resultaten van onze interne Prestatie- en haalbaarheidstest: de InnerBuddies Family & Friends-studie.

Wat is bacteriële abundantie? Uitleg voor beginners

Bacteriële abundantie betekent simpelweg de 'hoeveelheid' of 'aantal' bacteriën van een specifiek type in je darmmicrobioom. Dit kan op twee belangrijke manieren worden gerapporteerd:absolute abundantie en relatieve abundantie.

Absolute vs. Relatieve Abundantie: een belangrijk verschil

• Absolute abundantie: Dit is het werkelijke aantal bacteriën van een soort, bijvoorbeeld per gram ontlasting. Dit wordt vaak gemeten met zeer nauwkeurige technieken zoals ddPCR (digital droplet Polymerase Chain Reaction). Het geeft een kwantitatief beeld van de werkelijke aantallen.
• Relatieve abundantie: Dit is het percentage dat een specifieke bacteriesoort vertegenwoordigt binnen de totale gemeten bacteriële gemeenschap. Als je de relatieve abundantie van alle gedetecteerde bacteriën bij elkaar optelt, kom je uit op 100%.

In onze eerste versie van het InnerBuddies advies hebben we gewerkt met relatieve abundantie. We vergeleken de percentages van belangrijke bacteriën bij een individu met de 'gezonde ranges' waargenomen in ons gezonde referentiecohort.

Hoe zit de InnerBuddies Family & Friends-studie in elkaar?

Voordat we onze aanpak verder ontwikkelen, wilden we eerst de werking en haalbaarheid intern testen. Daarom hebben we een kleine pilotstudie opgezet met 50 deelnemers uit onze directe omgeving (familie & vrienden). Uiteindelijk hebben 40 deelnemers het volledige programma van 4 weken afgerond.

De opzet was als volgt:

• Duur: 4 weken (september 2022).
• Monsters: Van elke deelnemer verzamelden we 4 ontlastingsmonsters: een basislijn (juni 2022), een startmeting (week 0), een meting halverwege (week 2) en een eindmeting (week 4).
• Interventie: Op basis van het eerste ontlastingsmonster kreeg elke deelnemer een persoonlijk ingrediëntenadvies (V1). Ons diëtistenteam vertaalde dit advies naar een weekmenu.
• Evaluatie: Door de groep goed te kennen, konden we deelnemers indelen in drie groepen op basis van hun naleving van het advies: goed (GROEN), redelijk (GEEL) en beperkt (ORANJE).

We analyseren de resultaten door te kijken naar de verschuivingen in bacteriële abundantie en diversiteit tussen de verschillende meetmomenten.

Resultaten: effect op diversiteit en abundantie

De grafiek hierboven toont de vooruitgang in diversiteit. Een belangrijke conclusie is dat deelnemers die het advies beter opvolgden (GROENE groep), gemiddeld een hogere microbioomdiversiteit behaalden dan de andere groepen. Diversiteit wordt in veel wetenschappelijke studies in verband gebracht met een robuuste darmgezondheid.

Veranderingen in abundantiestijging van specifieke bacteriën

De onderstaande tabel toont de gemiddelde procentuele verandering in relatieve abundantie van belangrijke bacteriegroepen tussen de start- en eindmeting voor alle deelnemers die het programma voltooiden.

Categorie / Bacterie	Gemiddelde verandering
Diversiteitsindicatoren
Shannon-index	+ 5,17%
Aantal OTU's	+ 9,22%
Positieve Bacteriën (gemiddeld)	+ 8,85%
Bifidobacteriën	+ 23,54%
Akkermansia	+ 96,69%
Lactobacillen (Melkzuurbacteriën)	+ 24,56%
Negatieve Bacteriën
Escherichia-Shigella	- 16,78%
Klebsiella	- 34,27%

De resultaten suggereren dat een gepersonaliseerd voedingsadvies, indien goed opgevolgd, de samenstelling van het darmmicrobioom in een relatief korte periode in een gunstige richting kan sturen. Dit was een interne haalbaarheidstest; grotere, gecontroleerde studies zijn nodig om deze bevindingen verder te valideren.

Veelgestelde vragen over bacteriële abundantie

Wat is bacteriële abundantie?

Bacteriële abundantie verwijst naar de hoeveelheid aanwezige bacteriën van een bepaald type in een omgeving, zoals de darm. Het kan worden uitgedrukt als een absoluwt aantal (bijv. cellen per gram) of als een relatief percentage van de totale bacteriële gemeenschap.

Wat zijn typische ranges voor bacteriële abundantie?

De 'range' of het 'normale bereik' hangt sterk af van de meetmethode. Bij relatieve abundantie (in percentages) kunnen gezonde waarden voor een specifieke bacteriefamilie bijvoorbeeld variëren van 0,1% tot 10% van het totaal. Deze ranges worden bepaald door te kijken naar gezonde referentiegroepen.

Telt relatieve abundantie op tot 100%?

Ja, dat klopt. Relatieve abundantie geeft het aandeel van een bacteriegroep weer ten opzichte van het totale gemeten microbioom. Als je alle gerapporteerde relatieve abundanties van een monster bij elkaar optelt, is de som altijd 100%.

Meet InnerBuddies absolute of relatieve abundantie?

In de beschreven V1-studie werkten wij met relatieve abundantie, gebaseerd op sequencing-technologie. De percentages van belangrijke bacteriën werden vergeleken met onze gezonde referentiegroep. We zijn ons ervan bewust dat absolute kwantificering aanvullende inzichten kan geven en houden dit in onze methodologische ontwikkeling nauwlettend in de gaten.

En nu? De evolutie naar gepersonaliseerd advies op basis van functie

Op basis van de ervaringen uit deze test en nieuwe wetenschappelijke inzichten, ontwikkelen we momenteel een geüpgradede versie (V2) van ons adviessysteem. De belangrijkste verschuiving:

• Van bacteriën naar functies: In plaats van alleen te focussen op de abundantie van individuele bacteriën, gaan we kijken naar 'bacteriële paden' of functies. Dit zijn de biologische taken die door bacteriën worden uitgevoerd.
• Voordelen: Functies zijn stabieler en universeler dan de aanwezigheid van specifieke bacteriesoorten. Hierdoor kan ons advies mogelijk persoonlijker en effectiever worden, en beter werken voor mensen met verschillende dieetachtergronden wereldwijd.
• Volgende stap: We zijn van plan om deze nieuwe aanpak in extern wetenschappelijk onderzoek te testen in samenwerking met universitaire partners.

Deze interne pilotstudie is een eerste stap. De gepresenteerde resultaten tonen belofte, maar zijn geen vervanging voor grootschalige klinische trials. Ons doel blijft om veilige, wetenschappelijk onderbouwde en persoonlijke voedingsondersteuning voor de darmgezondheid te ontwikkelen.