Je darmmicroben leven in de darmen en halen voedingsstoffen uit voedsel. Verschillende soorten groeien het best bij verschillende voedingsmiddelen, dus wat je eet kan sommige microben doen toenemen en andere doen afnemen.
De samenstelling van de microbiota beïnvloedt ook wat je darmen produceren. Vele microben fermenteren vezels tot korte-ketenvetzuren, die de darmwand ondersteunen en ontstekingssignalen verminderen.
Je lichaam en je microben communiceren ook via het immuunsysteem. Wanneer de balans van microben verandert, kunnen immuunresponsen en de werking van de darmen ook verschuiven, wat soms de spijsvertering en de langetermijngezondheid beïnvloed.