Fermentatie zet voedselsuikers of eiwitten om in nieuwe verbindingen. Veelvoorkomende resultaten zijn melkzuur, azijnzuur, kooldioxide en alcohol. Deze veranderingen kunnen de smaak en houdbaarheid verbeteren terwijl ze ook de voedingsstoffen voor sommige mensen gemakkelijker opneembaar maken.
Veel gefermenteerde voedingsmiddelen bevatten levende microben, terwijl andere vooral “microbiële restjes” leveren, zoals organische zuren en enzymen. Je maag- en dunne darmvertering zal sommige levende microben verminderen, maar de stoffen die ze achterlaten kunnen nog steeds invloed hebben op je darmmilieu.
In de dikke darm kunnen deze stoffen invloed hebben op welke microben het best groeien. Dit kan helpen de balans te verschuiven naar organismen die de spijsvertering en de darmbarrière ondersteunen, hoewel de reacties tussen individuen verschillen.