L'IBS influisce principalmente sulla digestione, ma può influire anche sulla vita quotidiana e sulla salute generale. Durante i periodi di riacutizzazione, il fastidio può ridurre l'appetito e rendere i pasti imprevedibili, il che può diminuire l'energia e aumentare la stanchezza.
Con il tempo, i sintomi persistenti possono influire indirettamente sul metabolismo. Ormoni dello stress e abitudini alimentari irregolari possono modificare la gestione del glucosio nel sangue e l'accumulo di grasso nel corpo. L'IBS di solito non causa danni all'intestino, ma i sintomi cronici possono influire sul sonno, sull'umore e sul benessere a lungo termine.
I rischi a lungo termine dipendono dalla persona. L'IBS non è la stessa della malattia infiammatoria intestinale, ma è importante escludere altre condizioni quando i sintomi iniziano, cambiano o peggiorano.