Comment puis-je savoir si j'ai des bactéries dans mon intestin ?

Le tube digestif humain abrite des billions de micro-organismes, notamment des bactéries, qui jouent un rôle essentiel dans le maintien de notre santé. Si vous avez déjà ressenti des troubles digestifs, une fatigue inexpliquée ou des déséquilibres du système immunitaire, la cause profonde peut être un déséquilibre de vos bactéries intestinales. Cet article de blog explique comment déterminer si vous avez des bactéries dans votre intestin (indice : oui !), comment reconnaître les déséquilibres bactériens intestinaux et les étapes pour évaluer et traiter ces problèmes. Découvrez comment l’évaluation de votre microbiome intestinal grâce à des tests avancés peut révéler des informations cruciales sur votre santé digestive et globale, et pourquoi comprendre votre écosystème bactérien unique est plus important que jamais.

Introduction

La santé intestinale est devenue un sujet central dans le domaine du bien-être, de la nutrition et des sciences médicales, et ce pour de bonnes raisons. Invisible à l’œil nu, le tube digestif est un écosystème animé qui abrite des billions d’organismes microscopiques — y compris des bactéries — qui influencent presque tous les aspects de votre santé. De la digestion et de la fonction immunitaire à l’humeur et à la clarté mentale, votre microbiote intestinal (la communauté de microbes résidant dans vos intestins) joue un rôle irremplaçable dans l’harmonie corporelle.

Reconnaître la présence et l’influence des bactéries intestinales vous permet de mieux comprendre vos symptômes de santé, vos besoins alimentaires et même d’éventuelles affections chroniques. Grâce aux progrès scientifiques, nous disposons désormais d’outils puissants comme les tests du microbiome pour analyser avec précision la composition bactérienne de notre intérieur. Ceux-ci peuvent aider à déterminer si vous souffrez d’un déséquilibre et orienter des traitements personnalisés.

Dans cet article, nous explorerons ce que sont les bactéries intestinales, comment reconnaître les signes d’un déséquilibre bactérien, les tests utilisés pour analyser votre microbiome et comment tirer parti de ces résultats pour améliorer votre santé. Que vous cherchiez à résoudre des problèmes digestifs ou simplement à optimiser votre bien-être, savoir comment évaluer vos bactéries intestinales est un point de départ puissant.

Comprendre les bactéries intestinales et leur rôle dans votre santé

Pour évaluer si vous avez des bactéries dans l’intestin, il est d’abord essentiel de comprendre ce que sont les bactéries intestinales et ce qu’elles font. Le microbiote intestinal humain se compose de bactéries, champignons, virus et autres microbes. Parmi eux, les bactéries sont les plus abondantes et les mieux étudiées. Chaque individu héberge des billions de bactéries, comprenant des centaines à des milliers d’espèces différentes. Ces bactéries vivent principalement dans le gros intestin et le côlon, et jouent des rôles essentiels pour la santé humaine.

La composition de votre microbiote intestinal est unique — un peu comme une empreinte digitale. Les bactéries bénéfiques (« bonnes » bactéries) aident à digérer les aliments, à absorber les nutriments, à neutraliser les toxines et à protéger contre les agents pathogènes. Ces bonnes bactéries incluent des genres comme Bifidobacterium et Lactobacillus. En revanche, des bactéries potentiellement nuisibles ou opportunistes peuvent coexister dans l’intestin, maintenues en échec par les bactéries bénéfiques. Les problèmes surviennent lorsque cet équilibre se rompt et que les bactéries nuisibles commencent à dominer, conduisant à ce qu’on appelle la dysbiose — un état que nous aborderons dans la section suivante.

Les bactéries intestinales influencent bien plus que la digestion. Elles produisent des vitamines comme la B12 et la K2, régulent le système immunitaire et contribuent même à la production de neurotransmetteurs, influençant significativement votre santé mentale. L’axe intestin-cerveau fait référence au système de communication bidirectionnel entre votre microbiote intestinal et votre système nerveux central, illustrant comment la santé intestinale influe sur l’humeur, le stress et les fonctions cognitives.

Plusieurs idées reçues existent au sujet des bactéries intestinales. Un mythe courant est que toutes les bactéries sont nocives, ce qui est totalement faux. En réalité, sans bactéries bénéfiques, notre physiologie aurait du mal à fonctionner normalement. Une autre méprise fréquente est que les probiotiques peuvent « réparer » instantanément votre microbiote. Bien que les probiotiques puissent être utiles, ils doivent s’inscrire dans une stratégie globale comprenant des choix alimentaires, des modifications du mode de vie et, si nécessaire, des tests guidés du microbiome.

Maintenir un microbiote diversifié et équilibré est étroitement lié au bien-être général. Une plus grande diversité d’espèces bactériennes intestinales tend à être corrélée à de meilleurs résultats de santé. Ainsi, connaître votre composition microbienne peut offrir des indications précieuses sur votre état de santé actuel et vos risques futurs. Avec ces bases, passons à la manière dont un déséquilibre des bactéries intestinales peut se manifester par des symptômes que vous avez peut‑être déjà ressentis.

Reconnaître un déséquilibre de la flore intestinale et son impact sur votre santé

Même si tout le monde a des bactéries dans l’intestin, l’écosystème bactérien de chacun n’est pas forcément optimal pour la santé. La dysbiose désigne le déséquilibre de la flore intestinale où les bactéries nuisibles prolifèrent et les bactéries bénéfiques diminuent. Ce déséquilibre peut être subtil ou sévère et s’installer progressivement à cause de facteurs liés au mode de vie ou apparaître brusquement suite à une maladie ou à la prise de médicaments.

Comment savoir si vos bactéries intestinales sont déséquilibrées ? Heureusement, votre corps envoie souvent des signaux clairs. Les symptômes courants de dysbiose comprennent :

• Problèmes digestifs : ballonnements persistants, gaz, diarrhée, constipation ou reflux acide.
• Fatigue : sensation de fatigue constante malgré un sommeil et une alimentation adéquats.
• Problèmes de peau : tels que eczéma, acné ou rosacée.
• Troubles de l’humeur : anxiété, dépression, irritabilité et brouillard mental.
• Immunité affaiblie : rhumes ou infections fréquents.

Un intestin dysbiotique peut aussi affecter la santé métabolique, entraînant une prise de poids, une dysrégulation de la glycémie et une inflammation de bas grade. Cela peut être particulièrement préoccupant car l’inflammation chronique est liée aux maladies auto-immunes, aux maladies cardiaques et au diabète de type 2.

Les causes de la dysbiose sont multifactorielles. L’alimentation joue un rôle majeur — les régimes riches en sucres et pauvres en fibres favorisent les bactéries nuisibles tout en privant les espèces bénéfiques. La surutilisation d’antibiotiques et d’autres médicaments peut éradiquer les bactéries de façon non sélective, diminuant fortement la diversité du microbiote. Le stress chronique perturbe la motilité intestinale et déclenche l’inflammation, tandis qu’un mode de vie sédentaire réduit encore la diversité microbienne.

Si la dysbiose n’est pas traitée, ses conséquences se propagent dans tout l’organisme. Des études récentes associent les déséquilibres microbiens de longue durée à des affections complexes comme le syndrome de l’intestin irritable (SII), les maladies inflammatoires de l’intestin (MII), l’obésité, et même des troubles neurologiques comme la maladie de Parkinson et Alzheimer.

Heureusement, ces changements ne se produisent pas du jour au lendemain et de nombreux symptômes sont réversibles par la modulation du microbiote. La reconnaissance précoce des signaux envoyés par votre corps peut vous aider à agir avant l’installation d’un trouble plus avancé. C’est là qu’un test dédié, comme un test du microbiome intestinal à domicile, devient déterminant, en offrant un instantané de ce qui se passe à l’intérieur de votre intestin.

Réaliser un test du microbiome intestinal pour détecter la présence de bactéries

Si vous vous êtes déjà demandé si les bactéries intestinales affectent votre santé, vous n’êtes pas seul. La meilleure façon d’obtenir une réponse définitive est de réaliser un test du microbiome. Ces outils, appuyés par la science, analysent vos bactéries intestinales et fournissent un aperçu détaillé de votre environnement intestinal. Parmi les options les plus accessibles et précises aujourd’hui figurent les tests du microbiome à domicile.

Qu’est‑ce qu’un test du microbiome intestinal ? Ce test analyse généralement votre échantillon de selles pour examiner l’ADN des bactéries vivant dans votre intestin. Il peut non seulement confirmer la présence de bactéries (que tous les intestins sains ont), mais, plus important encore, évaluer leur type, leur abondance, leur diversité et leurs proportions. Ces facteurs déterminent si votre microbiome est équilibré ou déséquilibré.

Il existe différents types de tests du microbiome :

• Tests ADN sur échantillon de selles : utilisent le séquençage de l’ARNr 16S ou le séquençage métagénomique shotgun pour identifier les espèces et souches bactériennes.
• Tests de culture bactérienne : cultivent les bactéries pour identifier des pathogènes spécifiques — mais c’est moins exhaustif et souvent dépassé.
• Tests respiratoires : utilisés pour des affections comme le SIBO (prolifération bactérienne de l’intestin grêle), mesurant les niveaux de gaz produits par les bactéries.

Les tests les plus informatifs utilisent des technologies de séquençage de l’ADN telles que l’analyse de l’ARNr 16S. Cette approche permet d’obtenir une vision large de votre environnement intestinal, montrant si des bactéries bénéfiques comme Lactobacillus et Bifidobacterium prospèrent ou si des bactéries potentiellement nuisibles dominent. Vous obtiendrez aussi des informations sur la capacité de production d’acides gras à chaîne courte, un marqueur essentiel de la santé intestinale.

L’interprétation des résultats peut être complexe. C’est pourquoi de nombreux experts recommandent de s’appuyer sur des professionnels formés pour évaluer les données. InnerBuddies propose un test du microbiome intestinal qui présente ces résultats sous forme de résumés accessibles et fournit des recommandations personnalisées basées sur votre profil microbien.

En fin de compte, le test du microbiome est un outil diagnostique précieux qui apporte de la clarté dans un domaine auparavant dominé par les approximations. Savoir ce qui se passe à l’intérieur de votre intestin vous permet d’agir de manière fondée — que ce soit par des probiotiques, une nutrition ciblée ou des changements de mode de vie.

Symptômes de la prolifération bactérienne : signes indiquant que vous pourriez avoir un excès de bactéries

Une forme particulièrement préoccupante de déséquilibre intestinal est la prolifération bactérienne. Cela se produit lorsque des bactéries — parfois même bénéfiques à leur emplacement habituel — colonisent des zones du tube digestif où elles ne devraient pas se trouver ou se multiplient au-delà de niveaux sains. La SIBO (prolifération bactérienne de l’intestin grêle) est la forme la plus connue, mais d’autres types de prolifération existent également.

La SIBO survient lorsque des bactéries du côlon migrent vers l’intestin grêle, perturbant la digestion et l’absorption des nutriments. Les symptômes de la prolifération bactérienne se recoupent souvent avec ceux de la dysbiose générale et peuvent inclure :

• Ballonnements persistants (souvent peu après les repas)
• Douleurs ou crampes abdominales
• Diarrhée ou constipation, ou alternance des deux
• Perte de poids inexpliquée
• Mauvaise absorption des graisses (selles grasses)
• Carences en vitamines (notamment en B12)

La distinction clé entre la prolifération bactérienne et la dysbiose générale réside dans la localisation et la gravité. La dysbiose affecte l’équilibre bactérien global du gros intestin, tandis que la SIBO implique une colonisation inappropriée spécifiquement dans l’intestin grêle. Cette prolifération peut avoir des répercussions importantes sur le métabolisme des nutriments, les réponses immunitaires et même la communication cerveau‑intestin.

Les facteurs de risque de la SIBO incluent des interventions chirurgicales gastro‑intestinale antérieures, une motilité intestinale ralentie (comme c’est fréquent en cas de diabète ou d’hypothyroïdie), l’utilisation chronique d’inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) et des affections comme le syndrome de l’intestin irritable. Le stress et une mauvaise alimentation favorisent également la prolifération bactérienne au fil du temps.

Le diagnostic de la prolifération implique généralement un test respiratoire au lactulose ou au glucose, qui mesure l’hydrogène et le méthane produits par la fermentation bactérienne dans l’intestin grêle. Combiner ce test avec un test de microbiome sur selles donne une image plus complète de l’activité bactérienne dans l’ensemble du système digestif.

Si une prolifération bactérienne est confirmée, le traitement repose sur un plan global : thérapie antimicrobienne, probiotiques ciblés, modifications alimentaires (comme un régime pauvre en FODMAP), puis reconstruction du microbiote avec des prébiotiques et des aliments favorables à l’intestin. Là encore, des tests détaillés — comme ceux disponibles chez InnerBuddies — peuvent aider à guider un rééquilibrage stratégique de vos bactéries intestinales.