L'examen des selles est une méthode simple et indolore qui consiste à analyser un échantillon de selles pour rechercher une infection, évaluer une inflammation ou explorer la santé digestive. Il existe plusieurs techniques, du test ciblé à l'analyse plus large du microbiote, et le choix dépend du contexte et des symptômes.
Qu'est-ce que l'examen des selles ?
L'examen des selles consiste à analyser un échantillon de selles pour rechercher une infection, une inflammation ou un signe de mauvaise digestion. Plusieurs techniques existent, de l'examen visuel à l'analyse moléculaire en laboratoire. Le choix de la méthode dépend de la question posée par le professionnel de santé.
Les selles reflètent une partie de ce qui se passe dans le tube digestif : elles peuvent contenir des agents pathogènes, des résidus alimentaires, des marqueurs de l'inflammation ou des micro-organismes du microbiote. Cet examen n'est pas un diagnostic en soi : il apporte des éléments que le médecin replace dans un contexte plus large. Comprendre les différentes méthodes permet de mieux se préparer et d'interpréter plus sereinement les résultats.
Pourquoi faire un examen des selles ?
Un examen des selles peut être proposé en cas de diarrhée qui persiste, de douleurs abdominales, de ballonnements, de constipation inhabituelle ou de signes de malabsorption. Il permet aussi de vérifier la présence de micro-organismes pathogènes comme certaines bactéries, parasites ou virus, ou d'évaluer une inflammation intestinale, notamment avec la calprotectine fécale.
Des facteurs comme un voyage récent, une prise d'antibiotiques ou un terrain immunitaire particulier peuvent justifier un examen plus ciblé.
- Diarrhée prolongée ou récidivante
- Douleurs abdominales inexpliquées
- Ballonnements ou inconfort digestif au long cours
- Signes possibles de malabsorption
- Recherche de sang ou de marqueurs d'inflammation dans les selles
Cette liste est donnée à titre indicatif : seul un professionnel de santé peut décider si un examen est nécessaire.
Les principales méthodes d'examen des selles
Les méthodes d'examen des selles peuvent être regroupées en plusieurs grandes catégories : examen visuel et microscopique, coproculture, recherche de parasites, détection d'antigènes ou d'ADN pathogène, marqueurs d'inflammation et analyse du microbiote. Chacune répond à une question différente et ne se prescrit pas dans les mêmes situations.
- Examen macroscopique et microscopique
- Coproculture (recherche de bactéries)
- Recherche de parasites et d'œufs dans les selles
- Recherche de sang occulte dans les selles
- Dosage de la calprotectine fécale
- PCR ou tests d'antigènes
- Analyse du microbiote intestinal
La coproculture vise à identifier une infection bactérienne en mettant en culture une partie de l'échantillon. L'examen parasitologique des selles cherche les parasites et leurs œufs ; il peut nécessiter plusieurs prélèvements. Les tests moléculaires, comme la PCR, détectent le matériel génétique de certains pathogènes et donnent souvent un résultat plus rapide. Le dosage de la calprotectine fécale évalue le niveau d'inflammation de la muqueuse intestinale, sans identifier la cause exacte.
L'analyse du microbiote intestinal examine la composition des micro-organismes présents dans l'intestin, avec une visée plus globale que la recherche d'un pathogène précis.
Comment se déroule un examen des selles ?
Le prélèvement se fait le plus souvent à la maison avec un kit contenant un récipient stérile, une spatule et des instructions. L'échantillon doit éviter tout contact avec l'eau des toilettes ou l'urine, afin de ne pas être contaminé. La quantité à prélever est généralement indiquée sur la notice ; il n'est pas nécessaire de remplir entièrement le récipient.
La conservation dépend du test : beaucoup d'échantillons doivent être gardés au réfrigérateur avant d'être apportés rapidement au laboratoire. Certains examens demandent plusieurs prélèvements à quelques jours d'intervalle, notamment pour la recherche de parasites. Chez le bébé et l'enfant, le recueil peut se faire sur une couche ou avec un collecteur ; des réponses plus précises sont proposées dans les questions fréquentes.
- Le kit de prélèvement doit rester propre jusqu'à son utilisation
- Un échantillon prélevé dans de mauvaises conditions peut ne pas être exploitable
- Le laboratoire peut fournir des consignes particulières pour chaque type d'examen
Ce que les résultats d'un examen des selles peuvent révéler
Un résultat positif de coproculture peut confirmer la présence d'une bactérie, mais le médecin vérifie s'il s'agit d'une infection ou d'un portage sans symptôme. Des marqueurs inflammatoires élevés, comme la calprotectine fécale, peuvent évoquer une inflammation intestinale ; d'autres examens sont nécessaires pour en préciser la cause.
La présence de sang dans les selles est toujours un signe à faire évaluer par un professionnel de santé. Un résultat normal ne permet pas d'exclure tous les troubles digestifs ; il doit être interprété avec les symptômes et le reste du bilan. Les résultats ne permettent pas de savoir si le microbiote est en cause, car l'examen clinique des selles et l'analyse du microbiote ne répondent pas aux mêmes questions.
Examen des selles et microbiote intestinal : quel lien ?
Les selles contiennent des micro-organismes issus du côlon, ce qui permet d'étudier la composition du microbiote intestinal à partir d'un échantillon de selles. L'analyse du microbiote mesure des indicateurs comme la diversité microbienne, les grands groupes bactériens et certains marqueurs fonctionnels. Elle s'intéresse à l'équilibre d'ensemble de l'écosystème intestinal plutôt qu'à la recherche d'un agent infectieux précis.
Pour mieux comprendre cette dimension globale, un test du microbiome peut compléter un examen des selles. Les informations obtenues peuvent soutenir une démarche de prévention ou d'optimisation de la santé intestinale, mais elles ne constituent pas un diagnostic clinique.
Une analyse du microbiote peut être utile pour mieux comprendre des symptômes digestifs récurrents dans une approche globale ; elle doit être discutée avec un professionnel de santé.
Quand envisager une analyse du microbiote ?
Une analyse du microbiote peut être envisagée par les personnes qui souhaitent mieux connaître leur équilibre intestinal, notamment après des troubles digestifs répétés ou un traitement antibiotique. Elle peut accompagner un travail sur l'alimentation, le mode de vie ou la gestion du stress, dans une optique de santé intestinale personnalisée.
La diversité du microbiote est un indicateur intéressant, mais une diversité plus faible ou plus élevée ne permet pas, à elle seule, de conclure à une maladie. Ce type d'analyse est particulièrement utile lorsqu'il est répété dans le temps pour observer l'évolution de son propre écosystème intestinal.
Pour un suivi dans la durée, l'adhésion santé intestinale peut accompagner la lecture et la mise en perspective des résultats. Ceux-ci gagnent à être relus avec un professionnel de santé ou un coach spécialisé.
Questions fréquentes sur l'examen des selles
Comment faire les examens de selles ?
Un examen des selles se fait à partir d'un échantillon prélevé à la maison avec un kit stérile, puis transmis au laboratoire dans les conditions indiquées. Concrètement, il faut recueillir une petite quantité de selles sans contact avec l'eau des toilettes, puis fermer soigneusement le récipient.
Comment recueillir ses selles pour une analyse ?
Placer un collecteur ou une protection dans la cuvette, prélever un petit échantillon avec la spatule et le mettre dans le récipient. Il faut ensuite respecter les consignes de conservation indiquées pour le test concerné.
Comment faire une analyse des selles d'un bébé ?
Prélever directement sur la couche avec l'outil du kit, en évitant les urines. Conserver l'échantillon selon les recommandations du laboratoire et l'apporter rapidement.
Comment réaliser un examen des selles chez un enfant ?
Utiliser une protection propre ou un collecteur adapté pour recueillir les selles de l'enfant. Le laboratoire peut donner des conseils pour rendre le geste plus facile et limiter le stress.
