Une dysbiose décrit une modification du microbiote, mais elle ne constitue pas à elle seule un diagnostic. Des associations entre le microbiote et certaines maladies sont étudiées, sans que cela prouve une cause unique ni permette de diagnostiquer une maladie à partir de symptômes ou d’un test du microbiote.

Microbiote intestinal, microbiome et dysbiose : définitions utiles

Le microbiote intestinal désigne la communauté de micro-organismes qui vivent dans l’intestin. Le terme microbiome est parfois employé pour parler de l’écosystème microbien dans son ensemble et de ses caractéristiques. Quant à la dysbiose, elle décrit une modification de l’équilibre microbien : c’est une observation à interpréter selon le contexte, et non une maladie en soi.

• Microbiote intestinal : communauté de micro-organismes vivant dans l’intestin.
• Microbiome : terme parfois utilisé pour désigner l’écosystème microbien et ses caractéristiques.
• Dysbiose : modification de l’équilibre microbien à interpréter selon le contexte.

La composition du microbiote varie d’une personne à l’autre. Elle peut être influencée par l’alimentation, la prise de médicaments et l’état de santé général. Il n’existe donc pas un profil microbien unique qui correspondrait à une bonne santé.

Comment le microbiote est-il lié à la santé ?

Le microbiote intestinal participe à la digestion et interagit avec le système immunitaire. Ces fonctions sont largement décrites, mais elles ne doivent pas être confondues avec les associations observées dans les études : le fait qu’un microbiote donné soit plus souvent retrouvé chez des personnes atteintes d’une maladie ne signifie pas qu’il en est la cause.

La relation peut aussi fonctionner dans l’autre sens. Une maladie, un changement d’alimentation ou la prise de certains médicaments peuvent modifier la composition du microbiote. Il est souvent difficile de savoir ce qui précède quoi, et les résultats varient selon les populations étudiées, les méthodes utilisées et les individus.

Quelles maladies sont étudiées en lien avec le microbiote ?

Plusieurs maladies font l’objet de recherches sur leurs liens possibles avec le microbiote intestinal. Les maladies inflammatoires de l’intestin et le syndrome de l’intestin irritable sont étudiés comme deux sujets distincts. Des associations sont également explorées pour des maladies métaboliques comme l’obésité et le diabète. À ce stade, ces travaux ne permettent pas de conclure qu’une dysbiose serait à elle seule la cause de ces affections.

• Maladies inflammatoires de l’intestin : liens avec le microbiote étudiés, sans preuve qu’une dysbiose en soit à elle seule la cause.
• Syndrome de l’intestin irritable : une association éventuelle ne permet pas de diagnostiquer une dysbiose.
• Obésité et diabète : associations métaboliques étudiées, qui ne démontrent pas que le microbiote soit l’unique facteur en cause.

Un profil microbien associé à une maladie ne constitue pas un diagnostic et ne détermine pas un traitement. En cas de symptômes ou de doute sur une affection, c’est une évaluation médicale qui permet d’établir un diagnostic et de définir une prise en charge adaptée.

Symptômes possibles et limites de l’autodiagnostic

Les symptômes parfois attribués à une dysbiose sont souvent peu spécifiques. Des ballonnements, des douleurs abdominales, une diarrhée, une constipation ou des changements du transit peuvent avoir de nombreuses causes possibles, digestives ou non. Par ailleurs, la fatigue, les problèmes cutanés, les variations de l’humeur ou les troubles du sommeil ne constituent pas des preuves d’un déséquilibre microbien.

• Symptômes digestifs non spécifiques : ballonnements, douleurs abdominales, diarrhée, constipation ou changements du transit.
• Situations à faire évaluer : symptômes persistants ou qui s’aggravent, fièvre ou perte de poids inexpliquée.

Une maladie se diagnostique par une évaluation appropriée, et non par une liste de symptômes ou par un test commercial isolé. Il est conseillé de demander un avis médical lorsque les symptômes persistent, s’aggravent ou sont sévères.

Habitudes générales favorables à la santé intestinale

Certaines habitudes générales sont souvent associées à une bonne santé intestinale, sans qu’il soit possible de promettre qu’elles modifieront le microbiote ou préviendront une maladie. Les besoins et la tolérance varient d’une personne à l’autre : mieux vaut avancer progressivement plutôt que suivre des règles universelles.

• Privilégier une alimentation variée et des fibres adaptées à sa tolérance.
• Envisager les aliments fermentés comme une composante facultative d’une alimentation variée.
• Maintenir une activité physique régulière et des habitudes de sommeil adaptées.
• Demander conseil avant des restrictions alimentaires importantes ou la prise de compléments.

Tests du microbiote : informations possibles et limites

Les tests du microbiote peuvent décrire certains aspects de la composition microbienne, selon la méthode utilisée. Ils ne diagnostiquent pas à eux seuls une maladie inflammatoire de l’intestin, un syndrome de l’intestin irritable, un diabète ou une autre affection. La signification clinique des résultats peut rester incertaine et dépend des méthodes employées comme de leur interprétation.

Ce qu’un résultat peut et ne peut pas établir

Un résultat de test décrit des caractéristiques microbiennes. Il ne prouve pas une cause, ne pose pas un diagnostic et n’indique pas un traitement efficace. Il est utile d’examiner les limites annoncées par le fournisseur et de discuter des résultats avec un professionnel de santé plutôt que de les interpréter seul.

Il ne faut pas modifier un traitement médical sur la seule base d’un résultat de test du microbiote. En cas de symptômes persistants, sévères ou préoccupants, une consultation permet de faire le point sur la situation.